甘薯EST-SSR遗传图谱构建

来源 :仲恺农业工程学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kalagou
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甘薯是我国重要的粮食作物和救灾作物,同时叶也是很受欢迎的食用菜,因此甘薯育种具有非常重要意义。甘薯遗传图谱的构建是建立切实有效的分子育种技术的重要基础;本实验以台农27(母本)和普宁菜种(父本)杂交F1为作图群体,用Joinmap4.0作图软件构建甘薯EST-SSR遗传图谱研究结果如下:1.从甘薯2000对初开发EST-SSR引物中筛选出父母本有差异的913对引物用于子代多样性分析。2.从913对引物对子代的PCR多态性扩增结果中,选取符合卡方统计分析且进入图谱的标记。实验共获得了这样的特异性EST-SSR标记1276个,其中来源于父本标记(分离比为1:1)392个,来源于母本标记(分离比为1:1)372个,来源于子代标记(分离比为1:3)512个。3.利用台农27×普宁菜种的F1分离群体为作图群体,用Joinmap4.0作图软件分别获得了父本和母本连锁群图谱。其中父本连锁群50个,含EST-SSR 128个,占标记总数的32.6%,每个连锁群上有2-9个标记位点,连锁群长度范围为0.6-81.6c M,覆盖基因组总长为1649.6c M,标记间平均遗传距离为12.888c M。母本连锁群31个,含EST-SSR121个,占标记总数的32.5%,每个连锁群上有2-53个标记位点,连锁群长度范围为1.2-192.8c M,覆盖基因组总长1075.5c M,标记间平均遗传距离为8.888c M。本研究结果的创新:全部选用通用性好的EST-SSR标记作图;而且获得的连锁图谱是目前运用EST-SSR标记数最多的图,为1276个;也是甘薯运用EST-SSR标记获得总图距最长的图,为1649.6c M。
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