甘蓝型油菜(Brassicaa napus)是世界上广泛种植并且十分重要的油料作物之一,如何充分利用油菜的杂种优势,高效地开展强优势杂交组合选育一直是油菜领域研究的重要方向。TN DH群体及其衍生的重构F2群体(RC-F2)是本实验室利用中国甘蓝型油菜品种Ningyou7及欧洲甘蓝型油菜品种Tapidor为亲本所构建的作图群体。本研究利用课题组多年积累的多性状多环境的表型数据及TN DH系的Illumina 60k芯片的基因型数据,开展种子产量数量性状位点的重分析。通过构建表型与基因型的不同的统计模型,评估油菜杂种产量的分子标记辅助选择与基因组选择的预测准确性,分析不同的遗传效应对油菜杂种优势及基因组选择预测准确性的影响。主要结果如下:1.对DH及RC-F2种子产量三个环境下的数据进行分析,得到杂种产量的杂种优势大小,以及杂种产量的遗传构成。发现杂种产量具有较强的杂种优势且显性效应为杂种优势的主要遗传基础,上位性效应次之。2.比较分子标记辅助选择与基因组选择对杂种产量预测准确性的高低。发现对于杂种产量这种复杂的性状,基因组选择(GBLUP、BayesCπ)的准确性要远高于分子标记辅助选择。3.比较不同的遗传效应对杂种产量预测准确性的影响。发现在基因组选择时显性效应模型(考虑加性、显性效应)可比加性效应模型提高33%预测准确性,上位性效应模型(考虑加性、显性、上位性效应)可比显性效应模型(考虑加性与显性效应)提高9%的预测准确性。显性效应对于基因组选择准确性的提高比上位性效应有更大影响。4.对16110个潜在的杂种产量进行模拟预测,并种植验证群体进一步验证预测准确性。同时选择模拟预测中表现最佳的1%潜在杂种,其产量比现有的318个杂种高16%。基因组选择模拟预测可以检测出更多优秀的杂交组合。5.对DH群体不同的性状进行基因组选择预测分析,比较不同的性状基因组选择预测准确性的差异。研究发现不同农艺性状的基因组选择的准确性与性状的遗传力呈正相关(除了含油量)。本研究通过对分子标记辅助选择、基因组选择以及不同的遗传效应对预测准确性的分析,以期能够建立一个合理有效的基因组选择模型。其能够有效的预测油菜产量及其他复杂性状,为油菜进行基因组选择提供一定参考意义。