新疆维吾尔族食管癌SELDI-TOF-MS蛋白质组图谱的分析

来源 :新疆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dajiange
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:由于早期食管癌(EC)症状不明显,大部分患者就诊时已是中晚期,仅1/3病例可行根治性手术切除,术后五年生存率为30%-48%。全部就诊患者的5年生存率不足10%。但是,早期食管癌若能实施食管癌切除治疗,其5年生存率可达84.1%,10年生存率约73%。因此,寻找能早期诊断食管癌的标志物己成为目前临床和基础研究的主要方向。近年来发展起来的表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术有望解决这一难题。SELDI-TOF-MS是一种以亲和为基础的质谱方法,能够在芯片上对蛋白质进行原位捕获和纯化,因此能对大量临床样本进行高通量的蛋白表达分析。本研究的目的即是通过SELDI-TOF-MS技术分析新疆维吾尔族食管癌患者和正常对照血清蛋白质组图谱的改变,筛选维吾尔族食管癌的差异蛋白,建立和优化新疆维吾尔族食管癌血清蛋白质组图谱的模型,尝试其在早期食管癌中的诊断作用,并探究其临床价值。材料和方法:采用SELDI-TOF-MS技术分析152例维吾尔族食管癌和49例维吾尔族正常对照者血清,用CM10蛋白芯片获得血清蛋白表达图谱,然后将所有蛋白表达谱进行数据分析。所得结果用ZUCI- PDAS(Cancer Institute of Zhejiang University-ProteinChip Data Analysis System)软件包分析蛋白表达差异,并建立新疆维吾尔族食管癌蛋白质组图谱诊断模型,用留一法交叉验证作为评估模型、判别效果的方法,以进一步验证上述诊断模型的区分能力。结果:152例EC和49例对照血清的原始蛋白指纹图谱标准化后,用ZUCI-PDAS在相对分子质量2000-20000Da范围内共监测到277个蛋白质荷比峰,其中135个在食管癌与对照组的差异有统计学意义(p<0.01)。通过软件包运算,用7个质荷比峰(5667.5944、5915.5052、5875.9478、5645.0247、6059.3041、6102.8642、5690.7198m/z)建立了新疆维吾尔族食管癌蛋白质组图谱诊断模型,其灵敏度和特异度分别为99.34% (151/152)和95.92% (47/49)。在留一法交叉验证中,其灵敏度和特异度分别为96.05%(146/152)和83.67%(41/49)。结论:用SELDI-TOF-MS技术分析新疆维吾尔族食管癌血清蛋白质表达谱,发现由7个差异表达蛋白及其特定组合构成的诊断模型可以有效区分新疆维吾尔族的食管癌和非癌健康人群,为新疆维吾尔族食管癌的诊断与筛查提供了一条崭新途径。SELDI-TOF-MS技术和生物信息学分析软件的联合应用是一种寻找肿瘤生物标志物的有效方法。
其他文献
肺癌是目前发病率和死亡率增长最快,对人类健康和生命威胁最大的恶性肿瘤。近年来对于肺癌的治疗手段和技术都有较大进展,但肺癌总的5年生存率仍只有14%[1]。在各类肺癌中腺
提出了一种利用二元相位光栅产生环形光源的新方法,并且可以实现环形光源的环半径和环厚度连续或固定可调。阐述了环形光源抑制相干噪声的原理,推导了环形光源半径及干涉腔长
目的:本实验通过构建癌性恶病质动物模型,观察经β2受体激动剂福莫特罗干预后,癌性恶病质小鼠一般状态及去瘤体重、生化指标、血清细胞因子、骨骼肌中Myostatin蛋白、生存期
本栏目发表的几篇讨论油画问题的文章,虽然角度不同,有的针对中国油画现状,有的从油画教学出发,有的则从某一画展“名称”谈起,但有一点却是共同的,这就是对中国油画存在的种
交响东西方传统走向世界文学──废名综论饶嵎体式的诗化、意境化,意象的古典化,使废名小说带着醒目的古典胎记,表明他对中国文学传统的深度回归与过多依傍。在传统大断裂、大崩
高校基层党组织是高校推进党建工作的主体。高校群团组织在党组织的领导下开展活动,是高校党委发挥政治核心作用的有力抓手。由于高校基层党组织与群团组织所代表的群众利益
本文利用1998年1月至2012年4月国际油价、国内农产品价格以及通货膨胀率的月度数据通过构建STAR模型研究了国际油价与国内农产品价格之间的相互关系。实证结果表明,国际油价
生物电阻抗测量技术(Bio-Impedance Measuring Technology,BIMT)是利用生物组织与器官的电特性及其变化,提取与人体生理、病理相关信息的一种无损伤检测技术。该方法具有无创
本报讯 如何完善水资源的法律保护制度,如何建立水资源公益诉讼制度,怎样以法律手段推进水资源的保护与合理运用?2008年6月19~20日,最高人民法院在天津召开了水资源司法保护研讨
报纸