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该实验室选择家蚕12种不同组织器官和细胞,构建5′端非偏性cDNA文库,对每个文库大规模EST测序.该文在获得的大规模EST数据基础上进行数据分析、挖掘,以期发现家蚕的重要功能相关基因,并获取基因表达的组织差异和特异信息.这些基因的功能和表达信息获得,对家蚕有用基因资源的深度开发及鳞翅目害虫的有效控制有重要价值.1基于EST数据的基因表达谱聚类方法该文采用基于大规模EST数据的基因表达谱聚类法,探讨在测序数据大量获得时从中提取有价值信息的数据分析方法.利用两两基因(contig)或样本(文库)的相关系数定义基因或样本间的距离,构建中高丰度表达基因和所有测序文库的进化树.从contig的进化树中获得具有一致表达特征的成组基因.文库进化树反映了构建文库的组织间的亲疏关系.利用Audic和Cleaverie<[63]>取得的一个新的适用于分析标签抽样数据显著性检验的成对状况比较法分析组织间差异表达基因,获得在两种组织间和同一组织不同时期基因表达显著不同的基因.2大规模EST特征该实验室以家蚕品种"大造"为材料,选取五龄幼虫重要组织丝腺、中肠、脂肪体、体液、生殖腺和发育期胚胎共构建12个非偏性cDNA文库,5′端方向大规模测序,获得81625个合格的EST序列,Phrap软件拼接获得24678个非冗余序列(UniGene),其中包括11627个重叠群(contig),13051个独立EST(Singleton).3.家蚕脂肪体组织基因表达谱4中肠组织特异表达基因5丝腺与卵巢组织基因表达特征6精巢候选特异表达基因