区域主导产业是指在区域经济发展中对其他部门的发展起到较强的带动或推动作用，在国民经济中居于主导地位的产业。区域主导产业选择正确与否，不仅关系到主导产业本身的发展，而且决定着该区域经济发展和产业结构的合理化。 在结构上，本文首先分析了区域主导产业选择的理论基础和区域主导产业相关理论，对区域的概念界定、区域产业结构分类、产业关联与产业结构、区域优势的确定、主导产业的基本概念、选择主体、运行基础以及主导产业的更替等问题进行了研究。随后，本文分析了区域主导产业选择的程序、原则、基准和约束条件。在总结了现有研究成果中比较成熟的传统的选择基准后，结合分析我国各区域确定主导产业应使用的准则，认为选择基准的确定应该以需求收入弹性基准、生产率上升率基准和产业关联度基准这三大基准为基础。另外，本文提出应该将科学发展观纳入区域主导产业的选择，认为区域主导产业的选择不仅要从经济角度衡量，也要从社会效益的角度进行考察，促进社会的全面发展。 最后，本文以上海市浦东新区张江高科技园区为例进行实证研究，依据所构建的评价指标体系，结合现有统计资料和专家调查意见，对张江高科技园区两大主导产业与上海市六个重点发展工业行业进行了对比，验证了构建的评价指标体系的可行性。