我国的证券投资基金业虽然起步较晚，但是发展迅速，受到社会各界的普遍关注。基金费用水平和结构作为体现基金持有人与基金管理公司利益均衡的表现点，其作用和意义显得尤为重要。 本文从证券投资基金业的发展现状入手，比较了我国与国际基金市场在发展水平、费用安排、法律监管等方面的不同。在简单分析我国开放式基金费用结构的基础上，运用基金运作费率和E/R比率两个指标，从不同角度分析了基金运作费用对基金收益的影响，得出以下结论：配置型基金的费用最高，债券型基金费用最低；基金规模越大，运作费用越低；基金运作时间越长，运作费用越低；基金的运作费用侵蚀了一大部分基金收益。 在对基金费用进行整体分析后发现，包括一次性费用在内的基金整体费用在费用水平、费用结构、收取方式和监管方面都存在着一些不合理的成分，如管理费按照固定费率收取，对机构投资者的短线套利资金没有惩罚措施等等。对此，笔者提出几点建议：管理费的提取应适当与基金业绩挂钩，设立多样化的一次性费用收取模式，对短线套利资金收取额外费用等等。 本文的创新之处在于：运用基金运作费率详细分析了我国投资基金的费用结构和费用水平；运用E/R比率分析了基金运作费用对基金收益的影响；设计了较为合理的管理费收取模式。