论文部分内容阅读
CFL2基因属于肌动蛋白结合蛋白cofilin家族成员之一,对肌纤维的形成和发育起着重要作用。本研究以固始鸡-安卡鸡F2代资源群体为试验素材,采用DNA池测序方法检测了CFL2基因共3个位点的遗传变异,采用PCR-RFLP、CRS-PCR-RFLP等技术对其中2个SNPs位点进行基因分型并将其不同基因型与F2代资源群849只鸡部分生产性状进行关联分析。克隆出了丝羽乌骨鸡CFL2基因的部分编码区序列,并对该基因的编码序列进行了生物信息学分析。运用实时定量PCR技术,研究丝毛乌骨鸡CFL2基因在不同周龄(1日龄、4、8、12周龄)不同组织(腿肌、肝脏和心脏)中的表达规律。旨在寻找与鸡经济性状相关的DNA标记,为进行鸡经济性状标记辅助选择并进行CFL2基因功能的研究打下基础。本研究得到如下结果:1、检测到CFL2基因的3个SNPS位点,1个位于第一内含子(T853G),2个位于3’UTR区(T2484C,G2545A),T853G和G2545A为新发现的SNPS。关联分析发现:T853G位点与半净膛率、胸肌纤维密度、γ-谷氨酰转肽酶、碱性磷酸酶、总甘油三酯达到显著相关性(P<0.05);G2545A位点与4周胫长、4周胫围、腿肌纤维密度和腿肌纤维直径达到显著相关性(P<0.05)。2、本研究克隆了丝毛乌骨鸡CFL2基因部分cDNA序列,预测到鸡CFL2蛋白氨基酸序列有12个磷酸化位点;该蛋白不具有信号肽序列;有4个疏水性区域;不具有跨膜螺旋结构;该氨基酸序列中含α-螺旋、β-折叠,β-转角及无规卷曲4种二级结构,具有ADF保守结构域特征,CFL2为高度保守的蛋白。3、实时定量分析发现鸡CFL2基因在腿肌中表达量最高,肝脏表达量最低,腿肌、心脏和肝脏中的表达量均达到显著差异(P<0.05),各组织中的表达量在8周龄时达到最高水平,与其他生长阶段达到显著差异(P<0.05)。