随着当前国际科技竞争态势日益复杂,建设科技强国成为我国实现高质量发展的战略新需求,我国需要依靠自身力量解决科技创新活动“卡脖子”现象与从0到1的原创性成果欠缺的难题。就我国科技创新发展现状而言,我国现仍存在科技资源配置不合理、科技创新投入产出效率低的问题。产学研协同创新的出现打破了创新主体固有的创新模式,创新主体可以通过合作实现技术与知识的有效融合,从而实现科学的科技资源配置,提高科技创新效率。因此,对产学研协同视角下科技创新效率进行评价并探究其影响因素对于优化区域科技创新活动效率、实现高质量发展具有重要意义。本文基于产学研协同创新理念,将科技创新活动分为创新研发与创新成果转化两阶段,通过分析各阶段创新主体的投入与产出,分别构建不同的指标体系,从统计年鉴中根据指标收集2008-2019年的面板数据,并通过两阶段DEA模型和DEA-Malmquist指数模型对我国长江经济带科技创新效率进行静态、动态分析,然后依据分析结果构建Tobit回归模型,使用Stata16.0对两阶段科技创新效率的影响因素进行实证分析。静态分析结果显示,总体上长江经济带创新研发阶段的科技创新效率高于全国均值,而成果转化阶段效率较全国均值而言偏低,且低于创新研发阶段的效率值,各省市效率值出现明显分化,限制两阶段综合效率值提升的主要原因是纯技术效率值偏低;动态分析结果显示,两阶段长江经济带整体上全要素生产率指数均大于1,时间维度上呈效率增长态势,总体而言创新成果转化阶段我国长江经济带各省市全要素生产率均低于创新研发阶段,且长江经济带内存在部分地区创新成果转化阶段全要素生产率指数小于1;对影响因素进行实证分析结果显示,在创新研发阶段,政府支持力度、数字化接入水平和企业资金支持起到了显著的正向作用;在创新成果转化阶段,经济发展水平、政府支持力度、数字化接入水平、企业人才支持、高技术产业规模与对外开放程度均起到正向作用。最后,根据本文实证分析结果对两阶段科技创新效率的提升提出了针对性的建议。