脆性X综合征相关FMR1基因3′非翻译区746T>C点突变的功能分析

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【研究背景】:  真核生物基因3′非翻译区(3′untranslated region,3′UTR)是调控基因表达的重要功能元件,其影响mRNA的半衰期,细胞亚定位及翻译效率,此外3′UTR还可作为微小RNA(microRNA,miRNA)的作用靶点来沉默基因表达。脆性X综合征(Fragile X syndrome,FXS)是引起遗传性智力低下的常见疾病之一。大部分FXS是由位于Xq27.3的脆性X智力低下基因1(fragile X mental retardation1,FMR1)5′非翻译区(CGG)n三核苷酸重复序列发生动态突变,继而导致相邻部位CpG岛异常甲基化引起其编码产物脆性 X智力低下蛋白(fragile X mental retardation protein,FMRP)的表达下降或缺失所致。近年有文献报道FXS前突变患者中发现FMR1基因3′UTR有点突变存在,提示FMR1基因3′UTR的异常可能参与FXS发病。MiRNAs是一类长度约为19~23个核苷酸非编码单链小分子RNA,能与mRNA的3′UTR结合,发挥转录后基因沉默功能。本研究小组在前期实验中证实有部分miRNAs能与FMR1基因3′UTR结合下调报告基因的表达。因此,我们推测FXS患者FMR1基因3′UTR的点突变可能与miRNA的作用有关,FXS致病基因FMR1的3′UTR是否与发病相关则尚未见详细报道。  【研究目的】:  本研究采并对FMR13′UTR的结构进行信息学分析,用生物信息学分析与体外试验相结合的方式验证FMR13′UTR突变对FMR1基因表达的影响,及其与miRNA的关系,对于阐明FXS发病机理具有探索性意义。  【方法】:  结合文献报道的FMR1基因3′UTR突变位点分布,的采用生物信息学软件分析hFMR1基因3′UTR的结构以及潜在的miRNA作用靶点。然后构建真核报告基因表达质粒,即以hFMR13′UTR(wild-type construct,WT)或其突变(mutation constructs,MUT)作为转录终止区的萤火虫荧光素酶报告基因。瞬时转染非神经源性HEK-293细胞及神经源性SH-SY5Y细胞,采用双荧光素酶突变前后荧光素酶活性变化。对有活性改变的突变点,转染表达载体后提取细胞RNA,用荧光定量PCR检测报告基因转录本的含量;提取细胞浆蛋白并合成RNA探针,作电泳迁移率实验(electrophoretic mobility shift assay,EMSA),观察WT及MUT两种探针与浆蛋白的结合差别;把野生及突变型3′UTR与候选miRNA共转染,观察miRNA对两种3′UTR活性的影响。  【结果】:  1.746T>C点突变位于hFMR13′UTR保守区。  通过生物学软件分析,共发现hFMR13′UTR上存在3个保守区,文献报道的四个突变位点均位于保守区,突变点附近有miRNA调控靶点。  2. hFMR13′UTR746T>C点突变在转录后水平下调报告基因的表达。  将hFMR13′UTR上突变前后的质粒分别转染HEK293细胞和SY5Y细胞。与WT质粒相比,746T>C突变型质粒的荧光素酶活性下降50%(P<0.01),其余个突变型质粒的荧光素酶活性无显著性差异(P>0.05)。荧光定量PCR结果显示,在HEK293细胞和SY5Y细胞中,与WT质粒相比,746T>C突变型质粒转录的mRNA均升高,差异有统计学意义。  3.746T>C点突变下调报告基因的作用可能3′UTR结合蛋白及miRNA有关。  通过电泳迁移率实验,本研究发现WT和746T>C片段均能与细胞浆蛋白特异性结合,且有细胞种属特异性。野生型片段与突变型片段在同种细胞内能与不同的浆蛋白结合。通过miRNA共转染,发现miRNA能对两型3′UTR的报告基因表达有不同的下调作用,且这种作用具有细胞种属差异性。  【结论】:  hFMR13′UTR T>C点突变在转录后水平影响报告基因转录,该突变点位于保守区,其作用与胞浆3′UTR结合蛋白及miRNA有关。
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