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第一部分对GWAS发现的乳头状甲状腺癌遗传易感性位点的确证实验背景:最近有两个基于欧洲人群的全基因组关联研究(Genome-wide association study, GWAS)报道了5个与甲状腺癌相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP):分别是rs965513(9q22.33),rs944289(14q13.3), rs116909374(14q13.3), rs966423(2q35)和rs2439302(8p12)。只有前两个SNP在其他独立的人群中得到了重复实验的确认,而且这5个SNP在中国人群中都还未经过证实。方法:我们利用快照多重单碱基延伸系统(SNaPshot multiplex single nucleotide extension system),对中国人群中的845个乳头状甲状腺癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)患者、503个良性甲状腺肿瘤(benign thyroid tumor, BN)患者和1005个健康对照进行了这5个SNP位点的分型。结果:在显性模型里,rs944289(P=8.007e-11)、rs965513(P=1.013e-4)、rs966423(P=1.688e-3)和rs2439302(P=1.096e-4)与PTC风险存在着明显联系。在中国人群里,rs116909374未发现存在多态性。随着累计风险等位基因数目的增加,其患PTC的风险也增加(P=5.929e-13)。相对于不含风险等位基因的个体(对照人群中占1.0%),带有6个风险等位基因的个体(对照人群中占1.4%)的比数比是23.587。没有个体是在这4个SNP位点中均为风险等位基因的纯合子,只有3个PTC患者携带有7个风险等位基因(PTC组中占0.4%)。位于14q13.3的SNP rs944289T与BN的风险也存在着联系(P=0.0070)。结论:由GWAS发现的4个与PTC风险相关的候选位点在中国人群里得到了确认:rs965513(9q22.33), rs944289(14q13.3), rs966423(2q35) and rs2439302(8p12)。随着携带风险等位基因数目的累计,患PTC的风险也随之增加。第二部分CAPZB基因遗传位点与甲状腺肿瘤易感性及血清TsH水平相关性的研究背景:一项基于高加索人群的全基因组关联研究(genome-wide association study GWAS)报道了两处与甲状腺肿风险相关的遗传位点:位于CAPZB基因上游的以rs10917468为主导SNP的位点,和位于CAPZB内含子的以rs12045440为主导SNP的位点。而另外一项基于高加索人群的GWAS发现,与rs10917468有连锁不平衡的SNP rs10917469(r2=0.60),在健康人群中与血清TSH水平相关。没有其他研究在另外的独立人群中揭示这两处遗传位点和血清TSH浓度之间存在相关性。方法:我们采用SNaPshot多重单碱基延伸系统(SNaPshot multiplex single nucleotide extension system),对870名乳头状甲状腺癌患者(PTC)、513名甲状腺良性肿瘤患者(BN)和1244名健康对照进行了rs12045440和rs10917468的分型。结果:在甲状腺肿瘤病人中,rs12045440和血清TSH水平存在显著相关性(p=0.001)。在rS12045440基因型为野生型TT的患者中,其TSH平均浓度比基因型为GG纯合子的患者低0.34mIU/L (mean.±D.1.91±1.62vs.2.25±1.65mlU/L)。不同基因型的TSH水平差异在甲状腺良性肿瘤病人中仍有统计学意义(p=0.003),但在PTC患者中该差异仅有边缘显著性(p=0.115)。甲状腺肿瘤患者中,SNP rs10917468与血清TSH浓度之间没有发现显著相关性(p=0.820)。这两个SNP的不同基因型在PTC/BN组和对照组中的分布也没有显著差异(rs10917468:p=0.989,BN组vs.对照组;p=0.896,PTC组vs.对照组。12045440:p=0.458,BN组vs.对照组;p=0.180,PTC组vs.对照组)。结论:这项基于中国人群的病例-对照研究发现,在甲状腺肿瘤患者中,特别是在甲状腺良性肿瘤患者中,位于CAPZB第一内含子的rS12045440与血清TSH水平存在相关性。