目的:明确云南西部鼠疫疫源地野外鼠形动物恙虫病东方体(简称Ot)的感染情况。分析鼠形动物感染Ot基因型的多样性以及不同海拔、生境、季节等因素对鼠形动物感染Ot产生的影响。方法:2015年12月至2016年10月选取梁河、剑川和玉龙疫源地进行野外捕鼠,采集鼠肝脾样本2538份。用磁珠法提取鼠样本基因组DNA,通过巢式PCR检测鼠形动物Ot 56k Da基因。将获取的Ot核酸序列与Gen Bank中选取的高度相似标准参考株序列构建数据库,运用DNAstar软件进行序列同源性比对和Mega7.0软件包构建系统发育树以确定野外鼠形动物Ot基因型。应用Epidata软件建立数据库。计算野外鼠形动物Ot感染率,应用R软件对数据进行统计分析,采用Chi-square Test、Fisher’s Exact Test比较不同疫源地、鼠形动物性别、季节、生境及海拔间野外鼠形动物Ot感染率的差异,检验水准为α=0.05。结果:收集2538只野外鼠形动物肝脾组织样本提取DNA(梁河630只、剑川1031只、玉龙877只),其中齐氏姬鼠、大绒鼠和中华姬鼠各占30.89%、19.11%和10.87%。检测野外鼠形动物2538份,有45份鼠肝脾DNA Ot扩增阳性,阳性率为1.77%。感染Ot鼠种包括齐氏姬鼠、中华姬鼠、大耳姬鼠、斯氏家鼠、黄胸鼠、社鼠、针毛鼠、白腹鼠、大绒鼠、臭鼩鼱、短尾鼩、灰麝鼩及毛猬。梁河、剑川和玉龙疫源地野外鼠形动物Ot感染率分别为2.86%(18/630)、2.13%(22/1031)和0.57%(5/877),梁河和剑川鼠形动物Ot感染率高于玉龙(χ~2=12.76,P=0.000;χ~2=8.31,P=0.004)。梁河斯氏家鼠Ot感染率最高,为7.38%(9/122);剑川大绒鼠Ot感染率最高,为4.44%(15/338);玉龙社鼠Ot感染率最高,为2.27%(1/44)。梁河家鼠疫源地鼠形动物Ot感染率高于剑川、玉龙野鼠疫源地(χ~2=5.66,P=0.017);优势鼠种与其他鼠种间Ot感染率无统计学差异(χ~2=1.767,P=0.184)。梁河海拔梯度1200～1400m和1400～1600m间野外鼠形动物Ot感染率明显高于海拔梯度1000～1200m(P=0.002;P=0.01),玉龙海拔梯度2800～3000m间鼠形动物Ot感染率明显高于海拔梯度≥3000m(P=0.015);其余海拔梯度间的野外鼠形动物Ot感染率有所不同,但是无统计学差异。不同季节、生境和鼠形动物性别间野外鼠形动物Ot感染率无统计学差异(P=0.057;P=0.802;P=0.906)。经Ot核酸序列比对分析,野外鼠形动物Ot基因型包括类Gilliam、类Karp和类TA763型,其中,类TA763型是首次在云南鼠形动物中被发现。结论:云南西部鼠疫疫源地有多种野外鼠形动物感染Ot,Ot感染率为1.77%。梁河、剑川鼠形动物Ot感染率高于玉龙,三个疫源地鼠形动物Ot感染率分别以斯氏家鼠、大绒鼠和社鼠最高;家鼠疫源地鼠形动物Ot感染率高于野鼠疫源地。梁河海拔梯度1200～1600m鼠形动物Ot感染率高于海拔梯度1000～1200m,玉龙海拔梯度2800～3000m鼠形动物Ot感染率高于海拔梯度≥3000m。此外,云南西部鼠疫疫源地野外鼠形动物感染Ot基因型包括类Gilliam、类Karp、类TA763型,其中,类TA763型是首次在云南鼠形动物中被发现。