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核盘菌是重要的作物病原真菌,寄主范围广,由其引起的作物菌核病常年给油菜、大豆、向日葵等作物生产造成巨大的经济损失。真菌病毒是寄生于真菌细胞内的病毒。部分真菌病毒可以降低寄主的致病力,因其具备优良的生物防治潜力而受到研究者的普遍关注。筛选和寻找具有生物防治潜力的核盘菌弱毒病毒是关键性的第一步。对核盘菌真菌病毒的挖掘不仅可以丰富对真菌病毒多样性的认知,也为菌核病的防治提供丰富的资源库,同时还可以拓展对真菌病毒的研究领域。本实验对来自美国四季豆的1014个核盘菌菌核进行分离培养,通过形态观察筛选出80株菌落形态相对异常的菌株进行宏病毒组测序。测序结果显示共检测出27种病毒的核酸序列信息,分别属于正单链RNA病毒Mitoviridae、Alphaflexiviridae、Botourmiaviridae、Hypoviridae、Tombusviridae、Deltaflexiviridae和负单链RNA病毒Mymonaviridae。自菌株GB862中克隆了隶属于甲型线性病毒科(Alphaflexiviridae)的病毒Sclerotinia sclerotiorum Alphaflexivirus 1(Ss AFV1),其基因组全长6902 nt,3’末端具有poly A结构。病毒Ss AFV1基因组有4个线性排列的开放阅读框。其中ORF1长度为4401 nt,推定编码大小约为166 k Da的复制酶,包括正单链RNA病毒复制酶系中典型的甲基转移酶、解旋酶和依赖RNA的RNA聚合酶保守区域。ORF2长度为1107 nt,推定编码的蛋白大小约为40 k Da,为Allexivirus属特有的富含丝氨酸的蛋白。ORF3长度为783nt,与ORF3有207 nt重叠部分,推定编码外壳蛋白,大小约为28 k Da。ORF4长度为573 nt,推定编码的蛋白大小约为21 k Da,蛋白功能未知。根据复制酶氨基酸序列,该病毒属于甲型线性病毒科(Alphaflexiviridae)的一个新属。Ss AFV1的病毒粒子呈线性结构,直径10-20 nm,长度500-600 nm,病毒粒子表面光滑,可弯曲,没有突起结构。本研究发现了属于甲型线性病毒科的新病毒,为研究甲型线性病毒科病毒的生态学、系统发育和多样性等研究提供重要的研究材料。