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围绕回交后代遗传变异规律的分析与探索，以河北农科院遗传生理所植物转基因中心通过快速回交创造的具有独特性的小麦回交后代株系群体为对象，以SSR标记分析为手段，开展了如下较系统的研究：
1、根据Somers发表的小麦SSR标记图谱，按照在染色体上均匀分布的原则选出了296个SSR标记，经石4185、92R137初筛，获得了41个在双亲间具有多态性的标记。这些标记可用来对以石4185为轮回亲本、92R137为供体亲本经多代回交获得的后代株系群进行SSR分析。
2、从以石4185为轮回亲本、92R137为供体亲本，经多代回交获得的500多个后代株系群中选出了包括小麦新品种石麦14、金禾9123在内的126个有独特差异的回交后代衍生系，其中60个来源于18个BC4株、48个来源于23个BC5株、18个来源于9个BC6株。在连续3年的大田试验基础上，明确了各系的农艺性状特点。
3、用41个具有多态性的SSR标记，对126个回交后代株系(其中2个已育成品种)进行分析，检测出了四种标记带型：即供体亲本带型、轮回亲本带型、双亲杂合带型和非双亲带型；明确了不同回交株系问和部分回交株系内的后代株系间四种标记带型的比率差异。利用四种标记带型的比率差异可对回交后代的类型进行分类，也可分析判断回交后代及其衍生株系的遗传差异来源。
4、对两种非预期的标记位点类型的形成机制和作用进行了分析与推测。非双亲带型的出现可能是双亲杂交后因基因组互作而出现的DNA水平上的新变异，可导致回交后代的表型变异，形成回交后代的新类型特征。杂合带型的出现可能是相应SSR引物在基因组不同部位上发生同时扩增的结果，可能是双亲互补形成了一种发育活力或竞争力的“生理连锁”，但在回交后代表型中更多地体现为供体片段导入特征。
5、初步明确了3个SSR标记与农艺性状密切相关。Xwmc487标记与主穗小穗数、主穗粒数、粒重负相关，与穗数正相关(P＜0.01)。Xwmc506标记与主穗小穗数、主穗粒数、粒重负相关(P＜0.01)。Xwmc764标记与主穗小穗数、粒重负相关(P＜0.01)。对其进行进一步研究，可探索正选择、负选择的依据。
本研究确定的41对SSR引物、四种带型比率模式、3个与农艺性状密切相关的SSR标记，对深入开展小麦分子遗传和快速回交育种研究具有学术意义和实用价值。