嗜盐古生菌ZJ204与ZJ206的16S rDNA及br基因核心序列分析

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从新疆阿尔金山阿牙克库木湖分离纯化得到嗜盐古生菌AJ6,革兰氏染色呈阴性、杆状、少数球形、菌体大小为0.2-0.6×1.6-4.2μm,最适NaCl和Mg2+浓度分别为15%和0.6%(w/v),在pH6-7条件下生长良好.从浙江省舟山市普陀区朱家尖泗苏村泗苏盐场海水水样分离出的嗜盐菌株ZJ204和ZJ206,革兰氏阳性,不运动,液体培养时细胞呈杆状.   在此基础上,进一步通过PCR方法扩增了菌株AJ6,ZJ204和ZJ206的16SrRNA基因(16SrDNA),测定了该基因的核苷酸序列,并利用“DNASTAR”软件包和“MEGA2”软件分析16SrDNA序列,对其进行同源性比较和系统发育学分析,建立了嗜盐古细菌的系统发育树.结果表明菌株AJ6与Nnm.sp.XA3-1和Nnm.ajinwuensis分在同一类群中,16SrDNA序列同源性分别为97.7%和97.9%;ZJ204与ZJ206序列同源性为99.0%,二者与Hfx.alexandrinus,Hfx.volcanii,Hfx.lucentense分在同一类群中,ZJ204与它们的16SrDNA序列同源性分别为96.7%,96.9%,97.2%,ZJ206与它们的16SrDNA序列同源性分别为95.7%,95.9%,96.3%.   另外,通过PCR方法扩增了菌株ZJ204,ZJ206的br基因核心序列,其GenBank登陆号分别为AY838280,AY838281.将br基因核心序列翻译成氨基酸序列后,与现有BR蛋白螺旋C至螺旋G的氨基酸序列比较,发现其差异显著,具有深入研究价值.
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