荧光/化学发光核酸检测新方法研究

来源 :武汉大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wylalone
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
特定单链核酸的检测在基因分析、临床诊断以及医学研究等领域应用广泛,近年来,许多检测单链核酸的方法不断涌现。其中,荧光和化学发光分析法由于具有仪器设备简单、灵敏度高、选择性好等优点,受到广大科研工作者的青睐。但是,在检测实际样品时,目标核酸的含量通常很低,因此需要进一步提高核酸检测方法的灵敏度。相比于聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)信号放大技术,恒温信号放大技术具有操作简单、适用性强等优点。本论文利用纳米材料、磁分离以及等温信号放大技术,在发展高灵敏核酸检测方面做了以下四个工作:1.利用核酸外切酶Ⅲ(Exo III)辅助的信号放大技术,结合嵌入型荧光染料SYBR GreenI与双链DNA作用前后体系荧光强度的变化,建立了一种新方法用于目标DNA的检测。当不存在目标DNA时,SYBR Green I嵌入到HP的双链部分,体系的荧光强度显著增强;当体系中加入目标DNA时,目标DNA与HP的环状部分杂交,茎。环结构被打开,形成双链DNA结构。Exo III将从HP的3’羟基末端逐个将其水解成5’单核苷酸的碎片。在Exo III降解HP的过程中,目标DNA会从HP上释放下来,并继续与另外一条HP杂交形成双链,诱导新一轮的循环。反应完成后,体系中的双链含量减少,加入SYBR Green I之后,体系的荧光信号减弱。该方法检测目标DNA的检出限为160 pM,并且能够有效地区分目标DNA与碱基错配序列。此外,该方法不需要对核酸序列进行修饰,可以节约实验成本。2.利用核酸Exo III辅助的信号放大技术,结合磁分离与恒波长同步荧光扫描技术,构建了一个普适的传感器同时检测两种目标DNA。通过链霉亲和素与生物素之间的特异性结合,将3’端修饰荧光染料的发夹结构偶联到磁珠表面。当体系中不存在目标DNA时,发夹结构的DNA不会被Exo III剪切,磁分离后,上清液中的荧光信号很弱。当体系中存在目标DNA时,目标DNA把发夹结构打开,形成双链DNA结构。Exo III从发夹结构的3’羟基末端逐个将其水解成5’单核苷酸的碎片,修饰在3’端的荧光染料释放到溶液中。在Exo III降解探针的过程中,目标DNA会重新变成单链结构,并继续同另外一个发夹结构杂交形成双链DNA,诱导核酸Exo III对新的发夹结构进行降解从而进入新的循环。反应后,通过磁分离,上清液当中的荧光信号显著增强。选择合适的荧光染料修饰不同的发夹结构,结合恒波长同步荧光扫描技术,可以实验两种目标DNA的同时检测。3.利用氧化石墨烯(GO)与脱氧核酶(DNAzymes)之间的相互作用,结合GO对单、双链核酸的吸附能力的差异,我们构建了一个均相的化学发光体系用于目标DNA的检测。当体系中不存在目标DNA时,通过π-π;堆积作用,PHIV吸附到GO表面,体系的化学发光强度很弱。当体系中加入目标DNA时,目标DNA与PHIV的目标识别区域杂交形成双链DNA结构。由于双链DNA与GO的作用力减弱,此时目标DNA与PHIV形成的复合物远离GO表面,体系的化学发光强度增强。该方法具有以下优势:(1)相比于荧光探针,本实验中使用的探针制备方法更简单,可以有效地降低实验成本。(2)该方法不需要使用复杂实验技术和实验仪器,并且灵敏度高、选择性好。此外,通过改变探针的碱基序列,该方法可以拓展到检测其它生物大分子。4.利用恒温链置换聚合反应(Isothermal Strand-Displacement Polymerase Reaction, ISDPS)辅助的信号放大技术,结合磁分离以及化学发光成像技术,建立了一种新方法用于目标DNA检测。将5’端修饰氨基的发夹结构HHIV-1偶联到羧基化的磁珠表面。HHIV-1环部分能够与目标DNA互补配对,茎部分有10个碱基互补配对。当体系中不存在目标DNA时,HHIV-1不能被修饰生物素的Primer-1打开,体系的化学发光信号很弱。当体系中存在目标DNA,目标DNA将HHIV-1的发夹结构打开,修饰生物素的Primer-1结合到HHIV-1与目标DNA形成的复合物上,启动聚合反应。聚合过程中,目标DNA从复合物上释放下来,与另一个HHIV-1结合,重新启动聚合反应,从而达到信号放大的效果。利用以上探针检测不同目标DNA时,需要使用不同的发夹结构偶联磁珠。为了简化实验操作步骤,我们将5’端修饰氨基的Primer-2修饰到磁珠表面,将生物素修饰在发夹结构上。检测不同的目标DNA时,只需要变换发夹结构的碱基序列。通过改变发夹结构碱基序列,结合化学发光成像技术,该方法有希望用于多种目标核酸的同时检测。
其他文献
目的:分析职业分类大典对我国医药代表的职业发展产生的深远影响。方法:通过讨论职业分类大典与职业发展的关系,分析纳入职业分类大典对医药代表的影响。结果与结论:职业分类
为探明新疆阿图什市不同土壤质地、不同树龄木纳格葡萄园土壤养分及矿质元素的特性,笔者分别以壤土、粘土、沙土质地幼龄和盛果期果园为研究对象,分别测定0~20、20~60 cm土样
通过对观念建构过程和影响因素的研究,设计促进观念建构的一般教学流程;在对盐类水解内容的分析和学情研究的基础上,确立基本理解和核心概念,围绕生活现象的认识、微观的理解
屋顶绿化并不是一个很新的概念,但目前在太原市推广的并不顺利。从屋顶绿化的起源发展说起,从自然条件、技术条件以及大众需求分析太原市建设屋顶绿化的可行性;着重从政策角
在碳酸钾和十六烷基三甲基溴化铵存在下,将N-(N-乙酰基-N-芳氨基乙酰基)-N-芳氨基乙酸与全乙酰化α-溴代葡萄糖反应合成出了7个新的N,N-二代甘氨酸四乙酰基葡萄糖酯(5a-5g),并利用I
祠堂文化是"礼俗社会"中宗族文化的核心。培田祠堂通过严谨的规划布局,构建起内涵丰富、语境深远的多重文化类型,形成具有共识的礼制性文化载体。本文通过分析培田祠堂文化语
目的:观察路径化围手术期中西医结合护理干预对结肠癌患者手术治疗效果的影响。方法:选择2015年10月-2016年10月我院收治的结肠癌患者60例为研究对象,随机分为观察组30例,对
酒渣鼻是一种常见的慢性损容性皮肤疾病,好发于面部中央,以短暂性或持续性皮肤发红、毛细血管扩张及丘疹脓疱为特征。酒渣鼻分为四个亚型和一个变异型。脉冲染料激光、二氧化
传统人治精神及人本观念横行和当下民众"义务警员"倾向①,造就了舆情民意青睐刑事司法审判之不争事实。网络语境下,如何应对舆情民意扩张造成的刑事司法审判危机成为司法机关