不动杆菌属菌种鉴定及vgrG Ⅵ型分泌系统毒力效应研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangyi101
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
不动杆菌属细菌是造成院内获得性感染的重要病原菌之一。近年来,不动杆菌属细菌,尤其是以耐碳青霉烯类抗生素为代表的多重耐药鲍曼不动杆菌分离率显著上升,给临床诊治带来极大挑战。多重耐药鲍曼不动杆菌的感染控制通常需要全方面的应对措施,包括风险因素识别、微生物的准确鉴定、耐药菌株的快速检测和识别,并实施感染控制和预防策略。由于不动杆菌属各菌种类型较多,且属内部分菌种间差异小,其菌种鉴定及分类长期以来一直不理想,而基于表型鉴定、16SrRNA基因测序等传统方法难以将其准确鉴定到种,在实际临床应用中一直缺乏快速、准确的鉴定方法。针对临床提出的现实问题,本研究选取2009年1月至2010年1月期间全国27个省市收集的2582株非重复不动杆菌属菌株,首先通过VITEC 2生化鉴定法和blaOxA-51-like基因进行菌种初步鉴定。其中385株blaOXA-51-like基因阴性菌和24株blaOxA-51-like基因阳性菌应用MALDI-TOF MS质谱进行二次鉴定,再通过16S rRNA基因与rpoB基因测序鉴定。由于公共数据库中暂缺相对完善与可靠的rpoB基因参考序列,本研究下载了全基因组序列截取rpoB基因作为参考。研究结果表明,目前临床广泛应用的生化鉴定、质谱都不足以准确鉴定不动杆菌属细菌,16SrRNA基因测序法也只能将不动杆菌属细菌准确鉴定到属。本研究设计的基于rpoB基因序列的鉴定方法克服了现有文献rpoB基因扩增片段过短、引物位置设计不一、相互之间无法比较、无鉴定标准等诸多缺陷,并根据现有数据提出rpoB基因序列相似度阈值为97%可作为界定不动杆菌属各菌种的分类新标准。另外,本研究通过对rpoB基因序列系统发生树分析,发现一簇由11株临床菌株构成的独立分支,极可能代表了一个不动杆菌属新菌种,我们依照惯例将其按不动杆菌属基因型命名为A.genomic species 33YU。细菌Ⅵ型分泌系统(T6SS)负责捕捉原核生物和真核生物细胞,将有毒效应分子定位到靶细胞,从而杀死靶细胞。T6SS细胞器在功能上类似于收缩噬菌体的尾部,由VgrG长钉聚体蛋白复合物穿透、攻击靶细胞。本研究通过敲除鲍曼不动杆菌ATCC17978、ATCC19606的vgrG基因明确T6SS元件在鲍曼不动杆菌生存能力、侵袭宿主细胞能力及调控相关耐药基因表达等方面的重要作用。研究结果表明。当敲除vgrG基因后,鲍曼不动杆菌的生长速度减慢,对细胞粘附能力降低,对小鼠的致死能力降低,但是生物被膜形成能力并无明显改变,提示vgrG基因在鲍曼不动杆菌的毒力形成中扮演重要角色,其毒力效应的改变并非通过生物被膜相关途径发挥效应。另外,vgrG基因的敲除对其耐药机制也存在影响,vgrG基因敲除株对哌拉西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢哌酮/舒巴坦等药物产生耐药,对氯霉素和链霉素药物敏感性增加。实验结果提示了鲍曼不动杆菌对β内酰胺类药物和舒巴坦复合制剂的一种可能耐药机制,并解释了抗生素环境下细菌毒力降低的原因,即抗生素环境下细菌可能通过vgrG基因表达下调或沉默产生耐药,但是毒力也随之降低。本研究也进一步提示在将来开发以细菌毒力效应为标靶的药物时,需考虑其对抗菌药物耐药所带来的负面影响。综上所述,rpoB基因测序法的分辨率高于生化鉴定、质谱鉴定与16SrRNA基因测序法,是一种快速、准确的不动杆菌属菌种鉴定新方法。T6SS元件中的vgrG基因在鲍曼不动杆菌的毒力与耐药机制调控中扮演重要的角色,是未来新药物开发的潜在标靶。
其他文献
当前我国的电网中用电信息采集还没有实现全面的覆盖,覆盖率还较高。用电信息采集系统是通过对用户的用电信息进行采集,从而实现实时监控、自动采集、计量异常等功能,要想实
国务院在2015年8月印发的《促进大数据发展行动纲要》中明确提出要"通过促进大数据发展,加快建设数据强国"。党的十九大报告更是明确要求"推动互联网、大数据、人工智能和实
以新发现的Dictyonemaflabelliforme-Staurograptus笔石带的典型分子和带化石,结合岩性及其组合特征确定了本溪火连寨寒武系-奥陶系的界限。在系统描述岩性的基础上对该区上寒武统沉积发展史及沉积环境进行了分析。
运用有限元分析理论,在ANSYS Workbench有限元软件中建立应急监测拖车车身骨架结构的有限元模型,并对其进行静力学分析和模态分析。根据分析结果采用拓扑优化方法对应急监测
锭杆是纺织机械中应用量较大的重要零件,其制造精度直接影响成纱质量、生产效率和使用寿命。根据锭杆的结构特点,借助企业现有的ZA28-20型滚丝机,开发设计了锭杆校直装置,该
为解决汽车设计过程中造型特征获取和设计完成后汽车造型意象认知二者之间的匹配问题,辅助设计师通过造型意象评价对设计方案进行合理选择,提出了一种基于感性工学和层次分析
城通公司成立八年多以来,从实际情况出发,克服点多、面广、工期紧、任务重、标价低、地方干扰多、施工难度大等困难,以经济效益为中心,践行成本管理观念,通过精细化管理、严
针对CNC在线视觉识别刀具磨损状态信息源单一、易受干扰导致识别准确率低、可靠性差的问题,提出一种基于异构数据融合的识别方法。采用自主研发的在线视觉检测装置和TCP/IP通