嗜水气单胞菌诱导的中华鳖cDNA文库构建及CCL20分析和表达研究

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:duan01
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首先在同一湿度不同温度下对同一规格的中华鳖卵进行了孵化,研究了其胚胎发育和初生幼体的形态特征,以及活动能力的影响。然后以致病性嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)人工感染的中华鳖(Trionyx sinensis)心肝、脾、肾组织为材料,应用SMART (switching mechanism at 5’end of RNA transcript)技术,构建了中华鳖全长的cDNA文库。首先用SMARTTM PCR cDNA systhesis kit合成全长的双链cDNA,通过琼脂糖凝胶分级分离技术切除小片段的cDNA,将大于500bp的cDNA连接到pGEM-T载体中,电转化到JM109感受态细胞中。在构建好的文库中,经测定,文库约含有4.3×105个重组子,重组效率92%,插入片段多在0.5-2kb之间。对库中长度大于1000bp的164个基因进行了测序,结果显示39个序列在中华鳖中首次发现,测序鉴定的基因包括免疫基因11个;信号转导基因6个:催化类基因15个;转运相关基因3个;结构基因7个;未知基因9个。本论文构建成的嗜水气单胞菌诱导的中华鳖SMART全长cDNA文库,为免疫基因全长序列的筛选奠定了基础。利用本实验室构建的中华鳖SMART全长cDNA文库,筛选并克隆得到编码巨噬细胞炎症蛋白3-a(CCL20)基因的cDNA目标序列,其开放阅读框(Open reading frame, ORF)为303bp,编码100个氨基酸组成的多肽链,CCL20表达蛋白的分子量为11429.3,等电点为8.71,根据同源性分析,中华鳖与黄喉拟水龟(Mauremys mutica)、西部锦龟(Chrysemys picta bellii)、密西西比鳄(Alligator mississippiensis)、原鸡(Gallus gallus)、斑胸草雀(Taeniopygia guttata)的同源性较高,其相似性介于71%-84%;和哺乳动物的同源性较低。推测中华鳖CCL20表达的蛋白为亲水性蛋白,其信号肽位于1-28氨基酸位点上,分裂点位于28-29位氨基酸之间。ExPASY分析显示蛋白质的亚细胞定位于细胞质和细胞核中。同时CCL20存在跨膜螺旋,而且在其多肽链的第34-77氨基酸位置上存在着结构功能域:SMALL-CYTOKINES-CC,为 CC亚族小型细胞因子区域,又名趋化因子。CCL20保守区域同时具有趋化因子超家族(Chemokine superfamily)和趋化因子CC亚族DCCL特殊结构域特征(35aa-95aa)。中华鳖CCL20蛋白的二级结构中含有较多的α螺旋、无规则卷曲和延伸链,其中α螺旋占总体的49%;无规则卷曲占总体的37%;延伸链占总体的12%。三级结构可以看出中华鳖CCL20蛋白的最多结构元件为α螺旋、无规则卷曲和延伸链。采用实时荧光定量PCR技术对中华鳖的CCL20基因的组织特异性和表达特征进行了分析,发现在正常组中,CCL20基因在脾脏中表达量最高,在肝脏、肾脏、心脏中都有微量表达,其相对表达量关系为脾脏(12.9倍)>肝脏(1.5倍)>肾脏(1.0倍)>心脏(0.75倍);嗜水气单胞菌刺激中华鳖第12h、24h、36h后CCL20基因表达量显著上升,并极显著高于对照组,同时随时间的延长,表达量缓慢下降。
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