随着知识经济时代的到来，科学技术在社会发展中的作用日趋显著。为了管理、评估和促进科学技术为本国社会发展服务，也为了评价和比较世界各国的综合国力与社会发展水平，近半个世纪来，科技指标开始受到世界各国的普遍重视，对于科技指标的研究也随之迅速发展起来。科技指标是观察和测度科学技术活动的一种方法。科技指标体系能以其具体、生动的数字描述科技活动的状况、变化过程和一般数量关系，准确地反映科学技术活动状况及其对社会、经济的作用和影响。科技指标体系是科技决策的基本依据，也是评价科技政策实施效果的重要工具，并能为一国的科技活动指明方向，促进科技创新。 自1985年实施首次科技普查以来，我国现已经基本建立了一套具有本国特色的科技指标体系。中国和日本的科技指标体系建立和科技指标的研究起步都比较晚，之后都相继的确立了“科教兴国”和“科学技术立国”的战略，在科技指标体系的建立及急需科技自主创新等方面都有很多相同之处，进行中日的科技指标比较研究，有利于借鉴其经验，建立更为科学合理的科技指标体系。 本文基于对NISTEP从1991年至2004年连续5期的科技指标报告和我国1-7号科学技术黄皮书的研究，分析了中日两国科技指标体系的构成和特点。以科技指标体系的合理构建和科技指标对科技发展尤其是科技创新的促进作用为比较基点，对两国的科技指标体系进行了初步的比较研究，分析了两国科技指标体系的异同及各自的特点，提出了在我国科技指标构建过程中，要确立科技指标体系为科技决策服务的价值取向；统一科技指标体系的口径，提高统计数据的利用率；重视科技指标的国际化与国际可比性；构建适合国情的科技创新及评价指标；并在统计学视角下对我国科技指标体系的完善提出了建议。