随着国家出台战略性新兴产业的相关政策,我国的高新技术产业发展进入到全新的时期,发展高新技术产业对于提高我国国民经济发展水平、结构调整都有积极的现实意义。西部地区经济综合实力较弱,高新技术产业发展滞后于全国平均水平,“粗放型”的增长模式带来的弊端日益明显。本文以系统的视角,对西部高新技术产业发展战略选择进行研究,论文通过一些学者以往对西部发展高新技术产业的战略进行回顾,基于导师的“环境要素结构功能”的分析模型,即从产业的环境、要素、结构和功能四个子系统维度出发,使用1995-2011年的高新技术产业发展数据,对西部高新技术产业发展战略环境进行实证分析,运用波士顿矩阵的变型模式——战略聚类模型对西部高新技术产业发展战略进行选择,并且详细分析了高新技术产业内部五个子产业的发展功能,确定西部地区发展高新技术产业的战略为扭转型战略,即利用机会扭转不利局面,同时集中力量发展具有优势的电子通讯设备制造业、医疗设备及仪器仪表制造业以及医药制造业。最后本文给出了西部地区发展高新技术产业的战略建议,集合多种手段扩大西部高新技术产业规模,缩小高新技术产业发展区域间的差距；高度重视高新技术产业创新能力；加强西部地区技术市场的培育,促进高新技术产业发展；西部地区重点培育专业化程度高的产业；健全区域内部高新技术产业化机制；提高产业要素投入水平。