近几年,我国实行了一系列对上市公司治理结构进行改革的措施,如制定并出台了《上市公司治理准则》、实行股权分置改革、完善独立董事制度等,希望通过完善公司治理结构,来提高上市公司的绩效,增强上市公司的市场竞争力和可持续发展能力。农业上市公司作为我国第一产业的代表,作为促进农业产业化经营的纽带,作为资本市场上资本运作的重要载体,能否健康成长关系着三农问题能否顺利解决以及国民经济能否良性发展。目前我国农业上市公司治理结构中存在着诸多缺陷与不足,这些最终都会阻碍我国农业上市公司经营绩效的提高。本文以农业上市公司为研究对象,通过对公司治理结构与绩效之间的关系进行实证分析,以期找出完善农业上市公司治理结构的措施,并以此来提高上市公司的经营绩效。为了避免单纯使用单一财务指标度量企业经营绩效的缺陷,本文运用了因子分析法求得农业上市公司的综合绩效,较好地对总共14个原始绩效指标,如总资产收益率、净资产收益率、每股收益、资产负债率、流动比率、速动比率、总资产周转率、存货周转率、应收账款周转率、主营业务利润率、主营业务收入增长率、总资产增长率、资产积累率、每股净资产等进行了处理。最终提取出相互独立的六个因子,这六个因子几乎完全包含了14个原始绩效指标所携带的信息,之后根据不同因子的方差贡献率,即不同因子携带全部原始绩效指标总信息量的比重进行加权汇总得到农业上市公司的综合绩效。根据农业上市公司经营绩效值,本文运用线性回归的方法就公司治理结构与经营绩效之间的关系进行了深入的研究。通过运用多元线性回归模型,得出农业上市公司治理结构与经营绩效的相关关系。研究结果表明,我国农业上市公司第一大股东的持股比例与经营绩效成正相关,流通股比例、是否国有上市公司和Z值与经营绩效成负相关;董事会规模与经营绩效呈现正相关关系,而独立董事比例和两职兼任与经营绩效呈现负相关关系;高级管理人员领取的年度报酬和持有公司股份与经营绩效正相关。其中,流通股比例、是否国有上市公司、董事会规模和独立董事比例四个变量与经营绩效的相关关系不显著。本研究认为我国农业上市公司应该从以下三个方面来改善治理结构从而提高经营绩效:大力培育机构投资者,加强公司外部治理;健全和完善独立董事制度;建立完善的管理层激励制度。