国家深化教育体制改革政策的不断出台，尤其是近期教育部提出的建设“双一流大学”的政策给高校发展带来了新的机遇和挑战，新形势下高校的财务管理工作面临着新的问题，因此高等学校迫切需要建立与当下高校事业发展态势相适应的财务管理体制，并不断改进财务管理工作的方法，做好资金的筹集、分配和使用的管理工作。预算是实现高校内部资源配置和资源效能最大化的有效手段，但目前高校的预算管理中存在各种各样的问题，例如预算管理意识淡漠、预算编制不科学、预算监督不到位、预算评价环节缺失等，因此有效的解决高校预算管理中存在的问题，对高校的健康、快速的发展具有积极的影响作用。　　鉴于此，本文主要采用文献研究、走访调查和案例研究等三种方法对MS学院预算管理体系进行分析，针对其存在的问题进行优化研究。主要研究内容:在对预算管理、预算管理体系等相关概念进行界定的基础上，对国内外预算管理理论的研究现状进行了综述;对MS学院的预算管理现状进行阐述，同时从MS学院预算管理组织机构、预算编制、预算执行、预算的控制和调整、预算分析五个方面对MS学院预算管理中存在的问题进行分析研究;针对MS学院预算管理体系中存在的问题，从预算管理的组织机构、预算编制、预算执行、预算的控制和调整、预算分析及预算评价五个方面来对预算管理体系进行优化;最后提出了MS学院预算管理体系优化的保障措施。　　本文研究不仅是适应MS学院自身可持续发展的需要，同时也适应高等教育体制改革的发展趋势，具有一定的理论和现实意义，尤其对同类高校预算管理工作具有一定的参考价值。