文昌鱼是一种珍贵的海洋动物，是世界上最古老的生物之一，被称为是由无脊椎动物向脊椎动物进化的“活化石”，具有很高的学术研究价值及经济价值。 秦皇岛海区的文昌鱼发现较晚，主要分布在秦皇岛昌黎海区，其分布面积之大，数量之多，为世所罕见。本文参考文昌鱼传统的分类标准，并结合文昌鱼栖息地的生态环境特征、形态学特征及同工酶分析等诸方面，将秦皇岛文昌鱼与我国其它主要产地的文昌鱼样本进行了比较，结果认为： 1．秦皇岛文昌鱼与青岛文昌鱼及厦门文昌鱼所栖息的生态环境基本相似；其主要形态学特征基本符合白氏文昌鱼的特点；从酯酶（EST）同工酶及可溶性蛋白（SP）的谱带分析来看，三地文昌鱼样本差异不大。因此三地文昌鱼应属于同一种——白氏文昌鱼Branchiostoma belcheri Gray，1847。 2．秦皇岛文昌鱼在肌节总数、腹孔前肌节数及腹鳍条数等形态学特征以及同工酶分析图谱上与青岛文昌鱼更为类似，因此建议将秦皇岛文昌鱼归属于白氏文昌鱼青岛亚种Branchiostoma belcheri tsingtaoense Tchang et Koo，1936。