鹅HMGR基因外显子6-8区域克隆、RFLP及其与鹅重要经济性状关联性分析

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3—羟基—3—甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)是胆固醇代谢过程中的限速酶,也是胆固醇合成中的关键酶。本文提取皖西白鹅与四川白鹅杂交F1代血液基因组DNA,参照人,鸡和猪HMGR基因的cDNA序列,利用DNAStar软件确定该基因在外显子6和外显子8上的保守区,设计引物克隆并测序了鹅HMGR基因外显子6~8区域的DNA序列;试验测定了皖西白鹅与四川白鹅杂交F1代101只鹅的重要经济性状,并利用HinfⅠ、ScrfⅠ、PistⅠ和HindⅢ4种酶对所扩增产物进行PCR-RFLP分析,研究了不同基因型与鹅重要经济性状的相关性。1.对鹅HMGR基因外显子6~8区域进行克隆测序,结果表明HMGR基因外显子6~8区域的DNA序列长1159bp,其中外显子6、7和8序列长分别为104bp、117bp和103bp,内含子6和7序列长分别为418bp和417bp。序列已提交GenBank,收录号EU753857。2.在PCR-RFLP分析中,4种内切酶中仅HinfⅠ和ScrfⅠ获得酶切多态性,其中由HinfⅠ酶切检测到A和B两个等位基因组成AA、AB、BB三种基因型,等位基因A和B的基因频率分别为0.3069和0.6931。ScrfⅠ酶切检测到C和D两个等位基因组成CC、CD和DD三种基因型,等位基因C和D的基因频率分别为0.6584和0.3416。3.对AA、BB、CC和DD基因型样本的PCR扩增产物进行测序,结果显示,在HMGR基因第7内含子第48位的碱基产生cCtgg→cTtgg突变,使得等位基因产生D→C突变,而在第7内含子第254位的碱基产生gaatC→gaatG突变,使得等位基因产生A→B突变。4.分析不同基因型与鹅重要经济性状之间的关联性,结果表明:不同基因型对鹅胴体性状的遗传效应主要体现在腹脂重和胸肌重2个性状,其中DD型能显著提高鹅腹脂重12.14%(P<0.01)和降低胸肌重12.80%(P<0.01);而AA型能显著降低腹脂重9.88%(P<0.01)和提高胸肌重9.18%(P<0.01)。对胴体性状比值的遗传效应主要体现在腹脂率和胸肌率2个性状。DD型能显著提高鹅的腹脂率(13.19%,P<0.01)和最大降低胸肌率的作用(-14.77%,P<0.01)。对羽绒性状的遗传效应体现在羽绒重、羽绒率和千朵重3个性状。CC型能显著提高鹅的羽绒重和羽绒率(12.39%和11.38%,P<0.01),AB型具有提高千朵重的效应(11.15%,P<0.05),而CD型则具有降低羽绒重(-8.50%,P<0.01)、羽绒率(-8.16%,P<0.05)和千朵重(-8.99%,P<0.05)的效应。对肉质性状的遗传效应体现在胸肌失水率、腿肌失水率、胸肌粗脂肪含量和腿肌粗脂肪含量4个性状。其中CC型显著提高腿肌失水率(11.31%,P<0.01),DD型显著降低腿肌失水率(-14.90%,P<0.01);CC型则具有显著提高胸肌(8.38%,P<0.01)的效应;AA型具有显著提高腿肌失水率(10.40%,P<0.01)的效应;AB型显著降低胸肌粗脂肪含量(-9.36%,P<0.05)和显著提高腿肌粗脂肪含量(19.32%,P<0.01),CD型显著提高胸肌粗脂肪含量(10.28%,P<0.01);BB型显著降低腿肌粗脂肪含量(-8.77%,P<0.05)。
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