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背景: 结直肠癌是全世界最常见的恶性肿瘤之一,其发病率在逐年增高,死亡病例数也逐年上升。影响结直肠癌的预后因素很多,其中最主要的是肿瘤分期,Dukes’A期根治术后五年生存率超过90%,但Dukes’C期的患者则仅有30%左右。故早期发现结直肠癌是提高患者生存率的关键。近年的研究表明,长片段非编码核糖核酸(LncRNA)在结直肠癌的发生、发展过程中具有重要的调控功能,起着癌基因或抑癌基因的作用。某些LncRNA表达量在癌组织中明显升高或者降低,提示其与结直肠癌的发生、发展有一定联系。基因芯片技术的快速发展为发现这些表达量异常的LncRNA提供了可能。故早期发现这些LncRNA,有望为结直肠癌的早期诊断、预测预后、个体化治疗甚至基因治疗提供新思路。 目的: 1.通过基因芯片技术检测5对结直肠癌及癌旁正常组织中LncRNA表达谱,筛选出表达差异的LncRNA。 2.检测LncRNAZSWIM8-AS1在结肠癌细胞株及结肠正常上皮细胞株中的表达是否存在差异。 3.探讨LncRNAZSWIM8-AS1在新鲜结直肠癌组织和癌旁正常组织中的表达水平及其与结直肠癌患者临床病理特征的关系。 4.检测LncRNAZSWIM8-AS1在石蜡结直肠癌组织和癌旁正常组织中的表达水平,结合随访资料分析其与结直肠癌患者预后的关系。 材料与方法 材料: 基因芯片筛选LncRNA的结直肠癌标本(5对),新鲜结直肠癌标本(50例)。结直肠癌细胞株(HT29、HCT116、SW480、LS174T)和正常大肠上皮细胞株(CCD841)。石蜡组织58例。 方法: 1.采用基因芯片技术从5对结直肠癌及癌旁正常组织中检测出有显著性差异的LncRNA。选取差异显著的LncRNAZSWIM8-AS1;然后采用同一批标本提取的RNA,运用定量逆转录-聚合酶链反应(qRT-PCR)方法检测其表达,采用配对T检验验证qRT-PCR结果与基因芯片结果是否相符。 2.运用qRT-PCR方法检测LncRNAZSWIM8-AS1在结直肠癌细胞株(SW480、LS174T、HCT116和HT29)及正常大肠上皮细胞(CCD841)中的表达水平,并采用独立样本T检验分析其表达是否存在差异。 3.运用qRT-PCR,检测在50例结直肠癌组织和相应癌旁正常组织中的表达水平,采用配对T检验方法分析其表达水平与结直肠癌患者临床病理特征的关系。 4.运用qRT-PCR,检测在58例石蜡结直肠癌组织和相应癌旁正常组织中的表达水平,采用配对T检验方法分析其表达水平与结直肠癌患者临床病理特征的关系,并结合随访资料分析其与结直肠癌预后的关系。 结果: 1.基因芯片检测结果,5对结直肠癌组织中表达差异的LncRNA共5751个(P<0.05,并且结直肠癌组织为癌旁正常组织表达量2倍及2倍以上或0.5倍及0.5倍以下),其中肿瘤组织中表达上调的LncRNA2310个,表达下调的LncRNA3441个。选择表达量高且差异在2倍以上LncRNA筛选,结果LncRNAZSWIM8-AS1的表达水平是癌旁正常组织0.449050461倍(P<0.01)。 2.LncRNAZSWIM8-AS1在结直肠癌细胞株SW480、LS174T、HCT116和HT29中的相对表达倍数(2-ΔΔCt)是分别为0.465±0.016,0.422±0.040,1.179±0.168,0.949±0.076。LncRNAZSWIM8-AS1在SW480和LS174T细胞为低表达,HCT116和HT29细胞较CCD841相差较小。独立样本T检验分析提示,与CCD841比较,LncRNAZSWIM8-AS1在SW480细胞中显著低表达(P=0.004),LS174T显著低表达(P=0.01)。但HCT116(P=0.181)和HT29(P=0.681)细胞无显著性差异。 3.50例结直肠癌患者癌组织中LncRNAZSWIM8-AS1的相对癌旁正常组织表达量为0.593±0.540。结直肠癌组织中LncRNAZSWIM8-AS1的相对表达量低于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.01)。 4.LncRNAZSWIM8-AS1的表达水平与结直肠癌的肿瘤大小、淋巴结分期(N分期)、转移分期(M分期)、pTNM分期(Ⅰ/ⅡvsⅢ/Ⅳ)显著性负相关(allP<0.05),而与性别、年龄、组织学分级、肿瘤分期(T分期)无显著性相关(allP≥0.05)。 5.58例石蜡结直肠癌组织中LncRNAZSWIM8-AS1的相对癌旁正常组织表达量为0.776±0.497。结直肠癌组织中LncRNAZSWIM8-AS1的相对表达量低于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.01)。 6.58例石蜡结直肠癌组织中LncRNAZSWIM8-AS1的表达水平与结直肠癌的肿瘤大小、转移分期(M分期)、pTNM分期(Ⅰ/ⅡvsⅢ/Ⅳ)显著性负相关(allP<0.05),而与性别、年龄、组织学分级、肿瘤分期(T分期)、淋巴结分期(N分期)无显著性相关(allP≥0.05)。 7.LncRNAZSWIM8-AS1低表达的患者DFS较LncRNAZSWIM8-AS1高表达的患者DFS更短,差异具有统计学意义(P=0.018)。HR(95%CI)1.88(1.10-3.20) 8.LncRNAZSWIM8-AS1低表达的患者OS较LncRNAZSWIM8-AS1高表达的患者OS更短,差异具有统计学意义(P=0.037)。HR(95%CI)2.11(1.35-3.55) 结论: 1.结直肠癌组织中LncRNAZSWIM8-AS1表达水平低于癌旁正常组织; 2.SW480及LS174T两株结直肠癌细胞株中LncRNAZSWIM8-AS1的表达水平低于正常大肠上皮细胞; 3.LncRNAZSWIM8-AS1的表达水平与结直肠癌的肿瘤大小、淋巴结分期(N分期)、转移分期(M分期)、pTNM分期(Ⅰ/ⅡvsⅢ/Ⅳ)显著性负相关(allP<0.05),而与性别、年龄、组织学分级、肿瘤分期(T分期)无显著性相关(allP≥0.05);提示LncRNAZSWIM8-AS1可能与结直肠癌的发生、转移有一定的相关性。 4.LncRNAZSWIM8-AS1在石蜡结直肠癌组织中表达水平与结直肠癌的肿瘤大小、转移分期(M分期)、pTNM分期(Ⅰ/ⅡvsⅢ/Ⅳ)显著性相关(allP<0.05),而与性别、年龄、组织学分级肿瘤分期(T分期)、淋巴结分期(N分期)无显著性相关(P≥0.05)。 5.结直肠癌患者LncRNAZSWIM8-AS1表达降低与预后不良相关。提示LncRNAZSWIM8-AS1可能成为结直肠癌患者新的预后指标和潜在诊断和基因治疗目标。