4个绵羊品种TGF-β通路关键基因InDel检测及其与生长性状关系分析

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xpzcz1994
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
动物分子育种、现代分子遗传学和DNA分析理论及技术的不断发展与进步,使得在 DNA 水平上直接进行基因分型、实现早期选种选育的可能性大为增加,极大程度地提高了选种的准确性。InDel(插入/缺失)标记具有简易的分型系统、较高的稳定性、较好的多态性,广泛地在动植物分子育种、群体遗传学分析等方面应用。  TGF-β信号通路在调控细胞的增殖分化、胚胎发育、骨骼形成等方面具有非常重要的作用,而LTBP1、THBS1、SMAD4、PITX2等基因是TGF-β信号通路中的重要成员。LTBP1可与TGF-β相结合,而THBS1可与LTBP1相结合,SMAD4则是TGF-β通路中重要的信号转导分子,PITX2是SMAD4下游的重要效应分子。本研究以同羊(166只)、湖羊(201只)、小尾寒羊(195只)和兰州大尾羊(69只)等4个品种绵羊(631只)为研究对象,探究TGF-β信号通路中的4个基因(LTBP1、THBS1、SMAD4、PITX2)以及邻近信号通路 LHX3 的插入/缺失变异对绵羊的体斜长、体重等生长性状的影响;旨在比较四种绵羊群体在生长性状上的差异,并阐明LTBP1、THBS1、SMAD4、PITX2等基因与绵羊生长性状的相关性,为绵羊分子育种提供数据支持。  研究结果表明:  1.对于 LTBP1 基因的 3 个 InDel 位点,共发现 9 种单倍型,多态性较丰富。InDel-1(rs1089171651)的DD基因型兰州大尾羊母羊的体斜长和十字部高显著高于ID基因型(P<0.05);InDel-2(rs1085487085)的ID基因型兰州大尾羊母羊十字部高和胸围极显著高于DD基因型(P<0.01),而II基因型小尾寒羊公羊胸围极显著低于ID基因型和DD基因型(P<0.01);InDel-3(rs1086780404)的ID基因型小尾寒羊体斜长显著高于DD基因型(P<0.05),而 ID 基因型兰州大尾羊母羊胸围和十字部高显著高于 II 基因型(P<0.05)。  2.对于THBS1基因的2个位点,发现了4种单倍型,多态性较丰富。在THBS1基因InDel-1位点(rs1092852024),II基因型湖羊体重极显著高于DD基因型(P<0.01),而ID基因型小尾寒羊体斜长极显著高于II基因型(P<0.01);THBS1基因InDel-2位点(rs1094397979),兰州大尾羊公羊 ID 基因型胸围极显著高于 II 基因型和 DD 基因型(P<0.01)。  3.对于SMAD4基因的InDel位点(rs595529487),鉴定出3种基因型,在4个绵羊品种中的多态性较丰富。DD 基因型兰州大尾羊公羊体重和十字部高显著高于 ID 基因型(P<0.05),而II基因型兰州大尾羊母羊胸宽和湖羊管围显著高于DD基因型(P<0.05)。  4.LHX4基因中没有发现多态性,在LHX3基因中发现了一个29 bp的InDel (NC_019460 g.3107494-3107522),在4个绵羊品种中的多态性较丰富。DD基因型同羊体斜长和胸宽显著高于ID基因型(P<0.05),II基因型小尾寒羊母羊体斜长显著高于ID基因型(P<0.05),小尾寒羊公羊ID基因型胸宽显著高于II基因型(P<0.05)。  5.PITX2基因中发现2个InDel位点(NC_019463: g.14890658-1489066和NC_019463:g.14885723-14885734),所有个体中都没有发现DD型,属于低多态性,在湖羊,同羊和小尾寒羊中发现了4种单倍型,兰州大尾羊中仅有2种单倍型。PITX2基因InDel-1位点ID基因型同羊母羊胸宽和小尾寒羊母羊胸深极显著高于II基因型(P<0.01);PITX2基因 InDel-2 位点 ID 基因型同羊母羊体斜长和湖羊母羊胸围显著高于 II 基因型(P<0.05)。  对TGF-β通路中的5个关键基因InDel研究表明,LTBP1、THBS1、SMAD4、LHX3、PITX2等5个基因的9个位点具有较丰富的InDel多样性,可以在绵羊分子育种中作为兰州大尾羊胸围和十字部高、小尾寒羊胸围和体斜长、湖羊体重和胸围以及同羊体斜长和胸宽等生长性状的候选DNA标记位点。
其他文献
当前我国教育贯彻的是素质教育,为了更好地满足社会发展的需求,如何促进学生创新精神、实践能力的提升,成为当前班主任教学工作的重点。职业院校与其他高校不同,班主任工作开展中也存在着很多的问题,只有实现工作方式与工作思路的创新,才能够确保职业院校育人工作的有序开展。  职业院校班主任的工作方法  职业院校教师面向的是15~21岁之间的学生,学生正处于心理、生理成熟期,也是价值观形成的关键点。教师需要明确
期刊
在小学阶段,班级管理的好坏,班级氛围的优劣,直接关系到班级中每一个学生的成长,尤其是中小学生的思想还不太成熟,没有形成良好的价值观和承受力,更考验了班主任在班级管理中的能力和素养。班主任作为一个班级的管理者和指导者,其工作方法、工作态度直接影响着班级的整体学习氛围和集体气氛,以及每一位学生的健康成长。而如何管理学生,让学生能够在生活中培养自己的价值观和人生观,提升自己的人格修养,是我们每个班主任应
期刊
在学校的影响下,大学生也提高了对职业生涯规划的关注度。但仅仅有关注是不够的,不少大学生对职业生涯规划的含义和意义不了解,也不能很好地把握职业生涯规划的程序和操作过程。这些问题导致了他们在进行职业生涯规划时会茫然困惑甚至无从下手,或只停留于表面形式,又或者不考虑主客观条件的限制一味按自己的喜好来规划,这使职业生涯规划应有的作用难以充分发挥出来,这些问题亟待解决,因此要探索管理学生的新模式。  职业生
期刊
国外学者将奶牛由妊娠后期(产前2~3周)转变为泌乳初期(产后2~3周)这一阶段称之为过渡期(transition period),以往称为围产期(Periparturient period)。以肝脏脂肪蓄积和脂肪变性
我们太平镇中心小学下辖8个村级小学,学区现有769名学生,147名教职工,其中村小教师共91名,平均年龄大约50岁,年龄老化较为严重,加上单班单科,教学工作没有对比、没有交流学习,导致教学工作闭门造车,教师失去工作活力,村小教学质量逐年滑坡。很多家长要把孩子转到中心校,中心校面临大班额,村小遭遇发展瓶颈。因此,如何激活教育神经末梢,如何提高村小质量,使村小能留住学生,是我们急需研究解决的问题。  
期刊
本试验选用288只健康一日龄艾维茵肉仔鸡(公母混养),采用2×2×3三因子析因设计,将288只试验雏鸡随机分成12组,每组设三个重复,每个重复8只鸡。硒的添加浓度为:0.15、0.3mg/kg,锗的
本试验旨在探究添加外源纤维分解酶及其组合对玉米秸体外发酵、纤维降解和湖羊生长性能、甲烷排放的影响。试验包括体外试验和体内试验两部分,其中两个体外试验筛选了能有效改
学校校园管理存在的问题  校园文化建设任重而道远  中华民族的文化具有悠久的历史,作为一种重要的精神存在,文化的作用不可忽视。许多小学忽视了校园文化的建设,校园缺乏深厚的文化底蕴,无法在潜移默化中渗透积极的思想文化教育。有的小学过于重视物质环境建设,忽视了校园文化建设,使得学校缺乏内涵、活力与特色。校园文化建设包括多方面的内容,但是不少学校仅仅是将校园文化建设理解为说教,文化建设缺乏层次性和多元性
期刊