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本文采用非变性PAGE法分析鸡微卫星DNA,在62种微卫星引物中筛选出多态性丰富且扩增条带清晰稳定的20对引物。利用微卫星标记技术检测了山东省3种地方鸡种:汶上芦花鸡(LH)、济宁百日鸡(BR)和日照琅琊鸡(LY)的遗传现状,统计分析了各群体的等位基因数(NA)、多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、群体间的遗传距离(DS)和相似系数(I)等。结果如下:汶上芦花鸡群:在20对微卫星位点上检测出24个等位基因,每个位点的等位基因数从2到6个不等,大小在100bp～300bp之间。位点CAU008、CAU052在群体中的等位基因数最多,为6,各位点的等位基因频率也各不相同;LH群体的平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.4500、0.5789,其中观测杂合度位点CAU008、CAU041最高为0.7000,位点CAU049、CAU054最低,为0.15000。济宁百日鸡群:百日鸡在20个微卫星位点上检测检测出23个等位基因,每个位点的等位基因数从2到4个不等,位点CAU008、CAU052在群体中的等位基因数最多,为4,群体的平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.3850、0.5488,其中位点CAU013、CAU052最高为0.8000,位点CAU049、CAU025最低,为0.15000。日照琅琊鸡群:琅琊鸡群在20个微卫星位点上检测出21个等位基因,每个位点的等位基因数从2到6个不等,位点CAU008在群体中的等位基因数最多,为6。平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.4375、0.5731,其中位点CAU013、最高为0.9500,位点CAU053、CAU054最低,为0.2000。对3种鸡群体综合分析,统计分析了各群体多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、群体间的遗传距离(DS)和相似系数(I)等,采用UPGMA法构建系统发生树。估计群体间的遗传分化,综合评价3种鸡群体的遗传多样性现状。结果表明:3种地方鸡在20个微卫星位点上共发现了68个等位基因,每个位点的等位基因数为2个到6个不等;每个群体的平均等位基因数分别为3.4、2.65和2.1;大小在110～300bp之间。期望杂合度与观测杂合度比较接近,多态信息含量在汶上芦花鸡(LH)中最大,为0.5015;在济宁百日鸡(BR)中最小,为0.4571。以Nei氏遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明:济宁百日鸡(BR)与日照琅琊鸡(LY)间的遗传相似系数最大,为0.8260,遗传距离最小,为0.1911;汶上芦花鸡(LH)与琅琊鸡(LY)间的遗传相似系数最小,为0.7230,遗传距离最大,为0.3243。3个品种鸡可聚为两类,济宁百日鸡与琅琊鸡聚为一类,汶上芦花鸡独自聚为一类。