为了探讨苹果梨多年来存在的争议,本实验选取延边地区的苹果梨作为材料,采用ITS和psbA-trnH对苹果梨及与之存在争议的梨属植物栽培种之间的关系进行研究分析,以期为苹果梨系统学位置的确定提供分子依据,主要研究结果如下：本研究首次从苹果梨中克隆了ITS和psbA-trnH序列,得到了3种ITS功能基因序列,即KC895396、KC895397、KJ011895(NCBI GenBank登录号)和2种ITS假基因序列,即KJ011896、KJ011897和苹果梨psbA-trnH序列,即KF657740。多序列比对结果表明,ITS假基因序列在5.8S区存在18bp的缺失,这是ITS功能基因与ITS假基因相区别显而易见的标志。对ITS2二级结构进行分析结果显示,ITS功能基因与ITS假基因中ITS2区的最小自由能明显不同,这可以用来区分ITS功能基因与假基因。ITS系统树表明,ITS功能基因与ITS假基因序列各自聚类,ITS功能基因聚类群中,东方梨和西方梨各自聚合成两个单系类群。ITS功能基因系统发育分析的结果表明,苹果梨与秋子梨关系紧密,ITS假基因分析发现苹果梨是较为特殊的种。psbA-trnH证据表明,苹果梨与沙梨优先聚类,表明苹果梨的母本来自沙梨。结合ITS和psbA-trnH证据,本研究认为苹果梨是沙梨和秋子梨的杂交种,母本来自沙梨,父本来自秋子梨,是较为特殊的种。