建国以来，特别是改革开放以来，我国政府越来越重视公共卫生事业建设。2003年“非典”发生以后，政府逐步加强对公共卫生的支持。我国公共卫生事业发展迅速，这为提高国民健康水平创造了有利条件。十八大报告重点指出，健康是促进人类全面进步发展的必然要求，要坚持为人民提供更高效和优质的医疗卫生服务。在肯定我国公共卫生事业建设取得成就的同时，我们也应该理性的分析其存在的问题。例如，如公共卫生资源配置效率低下，资源浪费或者产出亏空程度严重；在分布上存在明显的区域差异，甚至区域内部不同省市之间差异显著等等。对政府卫生支出效率的忽视，不仅不利于实现医改目标，而且不利于政府支出结构的优化。在广泛、深入了解目前我国政府卫生支出现状的基础之上，对我国政府卫生支出效率进行分析研究，从而有针对性地提出政策建议，对优化我国卫生资源配置以及政府支出结构都具有非常重要的意义。因此，本文利用DEA模型（数据包络分析方法）对全国31个省市的政府公共卫生支出效率进行分析、比较，对进一步提高我国政府卫生支出效率进行有益探讨。