研究发现,牛奶中含有大量的微生物,其中包含益生菌和致病菌。为了减少致病菌对幼龄动物的危害,养殖中一般对牛奶进行巴氏杀菌后再饲喂给犊牛。但初乳中的有益菌是初生动物肠道微生物的重要来源,巴氏杀菌过程会不利于幼龄动物肠道菌群的早期建立,以及肠道免疫系统和肠道消化系统的早期发育,并可能因此影响其生长发育和肠道健康。我们前期的研究结果显示,不同奶牛初乳中存在共有的核心菌,其中包括丰度较高的黄杆菌嗜热芽孢杆菌,这些菌可能对犊牛肠道菌群的早期建立和免疫系统的早期发育有重要的促进作用。为了验证这一假设,本论文首先分析巴氏灭菌对牛乳菌群结构的影响,并在从牛奶中分离鉴定黄杆菌嗜热芽孢杆菌的基础上,研究牛奶中添加该菌对大鼠仔鼠肠道菌群结构和肠道免疫指标等的影响,为开发新的犊牛有益菌提供理论依据。试验一巴氏杀菌对常乳中微生物多样性的影响为了探究巴氏杀菌对牛常乳中微生物结构的影响,本试验采集新鲜牛常乳样品,3份不做处理,另3份进行巴氏杀菌,通过16S rDNA高通量测序方法检测巴氏杀菌前后牛常乳微生物结构和多样性的变化。并将巴氏杀菌前后常乳进行平板培养。结果显示,巴氏杀菌极大减少了牛常乳中的活菌数量,但是对常乳的微生物结构变化不大。试验二牛初乳来源黄杆菌嗜热芽孢杆菌的分离鉴定前期试验发现,黄杆菌嗜热芽孢杆菌是牛初乳中的核心菌种之一。为了探究该菌的生物功能,我们通过传统的分离纯培养技术分离培养初乳中的芽孢杆菌菌株,并通过形态学鉴定、特异引物PCR方法及16S rDNA测序从中分离鉴定出黄杆菌嗜热芽孢杆菌。试验三灌服黄杆菌嗜热芽孢杆菌对初生大鼠肠道微生物及免疫的影响本试验首先对刚出生的仔鼠进行灌服牛奶的饲喂试验,每天隔离仔鼠进行独立饲喂,发现第12天的大鼠仔鼠可以脱离母鼠进行人工饲喂,且生长状况良好,因此后续试验均选择超过日龄12天的仔鼠。试验将出生14天的大鼠仔鼠根据相同体重的两只小鼠随机分为两组,每组7只。一组每日添加8×10~6CFU黄杆菌嗜热芽孢杆菌,另一组为空白对照组。仔鼠日常营养由巴氏杀菌常乳供给,黄杆菌嗜热芽孢杆菌添加试验为7天。饲喂结束后,分别测定两组仔鼠盲肠微生物结构、肠道绒毛长度及隐窝深度、回肠免疫基因的表达、回肠黏膜s IgA和总抗氧化功能。试验结果显示,短期添加黄杆菌嗜热芽孢杆菌增加了仔鼠盲肠内容物中有益菌粪杆菌属、罗伊氏乳杆菌的相对丰度（P=0.025,0.062）,并降低了致病菌Elizabethkingia属的相对丰度（P=0.062）。短期添加黄杆菌嗜热芽孢杆菌对仔鼠十二指肠（P=0.793,0.614）和回肠（P=0.722,0.874）绒毛和隐窝,以及回肠My D88、LYZ、IFN-β、IL-6和MUC2基因的表达均没有显著的影响（P=0.138,0.374,0.322,0.372,0.278）,对回肠黏膜s IgA分泌和肠道黏膜总抗氧化功能的影响不显著（P=0.167,0.272）,说明添加黄杆菌嗜热芽孢杆菌对仔鼠没有产生不利影响,但短期添加优化了仔鼠肠道菌群结构。