应用定量蛋白组学技术筛选不同生存期食管癌患者血清差异蛋白

来源 :新乡医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hrwhrw
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景食管癌具有极强的“中国特色”,仍是我国与肿瘤相关死亡的主要原因,呈明显地域性分布。预后极差,5年生存率只有15%左右。目前,食管癌临床预后评价仍以TNM分期为标准。然而,大规模流行病学调查时发现一些肿瘤组织分期与预后不一致的病例,即属于同一TNM分期患者具有不同的预后。这些提示,单纯使用形态学改变作为判断预后的指标存在一定的局限性。因此,寻找与食管癌预后相关预后评价分子指标具有重要的理论意义。目的筛选与食管癌生存期相关的差异表达蛋白,为指导临床治疗和判断预后风险提供参考。方法1.收集食管癌患者的术前血清标本及临床病理资料,并跟踪随访,明确患者术后生存时间,随访时间截止到2013年10月。根据生存期进行分组:生存期<3年组;3年≤生存期≤5年组;生存期>5年组。每组随机筛选10例血清样品,同时收集正常对照组血清10例。2.去除血清中的高丰度蛋白质,进行8标同位素相对和绝对定量标记(iTRAQ),之后联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行分析得到多肽片段定量信息。3.多肽质谱分析结果经Mascot2.2软件查库及Proteome Discovererl.3软件分析,得到蛋白的定性信息以及其在各组的相对定量。4.四组样品进行单因素方差分析,采用生物信息学对显著差异表达蛋白进行分类注释。通过EMBI-EBI蛋白质数据库获取详细蛋白质信息,筛选出与生存期相关的候选蛋白。结果1.在食管癌不同生存期患者血清中经质谱分析查库搜索共鉴定出556种蛋白,具有明显表达差异的蛋白253种(P<0.05)2.鉴定的556种蛋白分别参与18种生物学过程:蛋白代谢、刺激反应、分子转运、细胞转化等;参与17种细胞组成,如:细胞外基质、细胞膜、细胞质、细胞器、细胞核等;共有14种分子功能,包括蛋白结合、金属离子结合、酶活性调节、核苷酸结合等。3.以正常对照组为参照,在食管癌患者血清中有52种蛋白与食管癌生存期呈正相关,如载脂蛋白D、a-2巨球蛋白随生存期延长其表达明显上调;与生存期呈负相关的蛋白有48种,如血管紧张肽原、碳酸酐酶Ⅱ随生存期延长其表达明显下降。结论本研究提示应用iTRAQ技术寻找食管癌血清肿瘤标记物具有较好的应用前景,血管紧张肽原、碳酸酐酶Ⅱ、载脂蛋白D、a-2巨球蛋白有可能作为食管癌判断预后风险的生物标记。
其他文献
学位
目的探究唐山地区儿童CA-MRSA菌株的临床感染特点、分子分型及耐药性特征。方法收集2013年8月-2016年12月在儿童中分离到的金黄色葡萄球菌菌株,采用BD Phoenix?-100全自动细菌鉴定/药敏系统完成鉴定及药敏分析,头孢西丁纸片扩散法筛选出MRSA,调查病历确定为社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA),普通PCR技术和琼脂糖凝胶电泳技术检测mec A基因,以确证是MRS
目的:急性视网膜坏死综合征是临床中相对少见的眼科疾患,是一种由病毒感染引起的眼部疾病,典型的表现为灶状视网膜坏死以视网膜动脉炎为主的视网膜血管炎中度以上的玻璃体混浊和
在辅助生育特别是IVF-ET技术中,如何提高妊娠率仍然是众多学者关注的问题.子宫内膜发育和胚胎质量以及两者同步化是胚泡植成功的关键因素.促性腺激素释放激素激动剂(GnRHa)长
目的;该研究主要探讨准分子激光原位角膜磨镶术后兔角膜内皮细胞乳酸脱氢酶和还原型辅酶I的活性变化.结论;实验组与对照组及各实验组术后不同时间角膜内皮细胞两种酶活性比较
目的:研究异丙酚临床应用对人外周血T淋巴细胞是否有影响及其与异氟醚有否差异.结论:异丙酚,与异氟醚一样,临床应用对人外周血T淋巴细胞具有抑制作用,抑制程度异丙酚弱于异氟
苏柏斗(号善物常主)生于1971年,职业画家,中国美术家协会会员、马来西亚赤道艺术学院客座讲师。1995年就读于解放军艺术学院美术系;1997年赴马来西亚赤道艺术学院深造;1998年
运用高密度电法系统进行对隐藏构造、地质体的产状的推断,以矿石岩石的导电性和机电效应差异为基础,探测深度150米以上的电阻率和充电率进行资源勘探,在国内外的试验中都取得
目的:探讨百里醌(Thymoquinone,TQ)对兔角膜新生血管(cornealneovascularization, CNV)的抑制作用,并选择最佳的有效浓度。方法:选取45只健康无眼疾的新西兰大白兔,其中5只不做任
该研究对通过放射免疫分析法,薄层色谱分析法,Lowry法,抗坏血酸法等方法,对CPB心脏瓣膜置换术肺损伤过程中,体液中几种因子进行测定.结果显示:1.CPB期间及CPB后各时点血清IL-