因为国有独资公司的股东只有一个,即国家,故本文将保护股东利益与保护国有资产做等价处理,而要想研究股东利益的保护问题,就必然要研究公司的法人治理结构。建构法人治理机构的根本目的是要在公司所有者与经营者之间取得平衡,从而达到公司盈利的市场目标,由此带来的是股东利益的实现,对于国有独资公司来讲,就是国有资产的增值。我国公司法虽然对于股东会与董事会的职权范围作了明确规定,然而在现实中,股东会与董事会之间的权力界定并非是绝对泾渭分明,当对董事会的监督不力时,其作为经营者很容易实际上控制公司,损害股东利益,而对于国有独资公司来说,如果处理不当,就会牵扯到国有资产的流失问题。由此看来,公司制的管理模式能否实现以及如何实现国有资产的保值增值,是个值得探讨和思考的问题。故本文试图从这个角度着手进行研究。本文从界定国有独资公司和国有资产的概念入手,先破题,明确本文讨论的语境,以便更为明确的展开讨论。所谓国有独资公司的国有资产保护,一言以蔽之,就是在公司的治理结构之下,如何来保护公司股东的利益,也是《企业国有资产法》和《公司法》交叉的一个部分。要保护股东利益,就得先弄清楚是什么原因导致股东利益常常无法实现。本文通过分析找出了症结所在,即内部人控制问题。也试图提出解决方案,本文中阐述了两个,一为强化监事会职能,二则是建立外部董事制度。当然,如果过度保护股东利益就会过分限制经营者的自主权,最终结果还是损害股东利益,所以本文提出引入商业判断规则,以此来保护经营者的自主权。