菊花（Chrysanthemum morifolium）作为我国传统名花、重要的中草药植物以及世界四大切花之一,具备食用、药用、观赏等多种经济价值。病毒病是菊花生长过程中的重要病害,会使菊花出现花叶、黄叶、褪绿斑、枯斑、坏死斑以及植株矮化、畸形、不孕等症状,严重影响菊花的正常生长,造成其产量及品质的下降。本研究调查了北京地区菊花病毒病的种类及分布特征,并建立了 3种主要病毒的反转录重组酶聚合酶等温扩增（Recombinase polymerase amplification,RPA）检测体系;同时,建立了 3种病毒和2种类病毒的多重RT-PCR检测体系。主要研究结果如下:（1）对北京平谷区、顺义区、延庆区3个地区的菊花病毒病发生情况进行了调查。菊花感染病毒及类病毒的主要症状有:早花,花器官畸形,茎条状黑斑,花叶、叶片皱缩、黄化、畸形、紫脉以及植株矮化等,其中叶片黄化的比例最高。（2）采集疑似感染病毒病的菊花样本累计66个,针对国内常见的7种病毒和2种类病毒,利用RT-PCR法进行了检测,结果共检测到3种病毒和2种类病毒,分别是番茄斑萎病毒（Tomato spotted wilt virus,TSWV）、菊花B病毒（Chrysanthemum virus B,CVB）、番茄不孕病毒（Tomato aspermy virus,TAV）、菊花褪绿斑驳类病毒（Chrysanthemum chlorotic mottle viroid,CChMVd）和菊花矮化类病毒（Chrysanthemum stunt viroid,CSVd）。其中,检出率最高的病毒种类是CVB,高达96.97%,其次,检出率由高到低的病毒及类病毒种类依次是CSVd、CChMVd、TSWV、TAV,检出率分别为90.91%、89.39%、65.15%、33.33%。在检测的样本中,多种病毒（类病毒）复合感染的情况普遍存在,复合感染的检出率高达100%,3种病毒及2种类病毒共检测出12种复合感染组合,其中TSWV、CVB、CSVd和CChMVd复合感染的情况最为常见,占比高达30.30%;TSWV、CVB、TAV、CSVd和CChMVd 3种病毒及2种类病毒的复合感染率也高达25.75%。在顺义区、延庆区和平谷区均检测到3种病毒及2种类病毒,但在不同的地区,菊花复合感染的情况有所不同。（3）为实现病毒的快速检测,针对TSWV、TAV、CVB 3种主要的菊花病毒分别建立了其RT-RPA检测体系。在50 μL的反应体系内依次加入Rehydration buffer 29.5μL,ddH20 11.2 μL,上下游引物（10 μmol/L）各 2.4 μL,模板 cDNA 2.0 μL,MgOAc 2.5 μL。利用构建的RT-RPA体系,3种病毒可以在40℃下,于40 min内完成扩增,简单、快速,特异性良好,且灵敏度性高于单一 RT-PCR。（4）针对北京地区菊花中3种病毒及2种类病毒,建立了其同时检测的多重RT-PCR检测体系。对反应体系中的引物用量组合、模板含量以及PCR反应程序中的退火温度等进行了优化,确定了在20μL的多重RT-PCR反应体系中,TSWV、TAV、CVB、CChMVd、CSVd 的引物用量（10 μmol/L）分别为 0.6 μL、0.1μL、0.4 μL、1.4 μL、1.2 μL,模板cDNA用量为1 μL,退火温度为55.3℃。该方法可同时扩增出片段大小为485 bp、376 bp、292 bp、220 bp、110 bp的目的条带,特异性良好,灵敏度与单一 RT-PCR技术相当。