长期以来，我国海洋渔业的快速发展不仅为人民提供了大量生存所必需的蛋白质，提高了人民的生活水平，而且已经成为我国国民经济实现可持续发展的重要保障。然而，随着我国海洋渔业的快速发展，产业发展也面临着诸多困境，其中，投入要素的扭曲配置对该产业发展的制约尤为明显。如过度开发渔业资源，缺乏科学的统筹规划和相应管理，使我国海洋渔业资源开发利用显得盲目与混乱，不同区域经济发展水平以及对海洋渔业扶持力度不同，造成渔企获取资本的难易程度不同，海洋渔业从业劳动力素质普遍偏低，海洋渔业科技对产业发展的贡献度不足以及海洋渔业制度建设滞后，不能实现投入要素充分流动等都造成了我国海洋渔业投入要素的错配，使要素边际生产力低于帕累托最优水平，严重影响了我国海洋渔业的可持续发展。基于此，本文综合研究了我国海洋渔业各投入要素的配置扭曲对该产业全要素生产率的影响，并从要素优化配置的角度为我国海洋渔业发展提供了建议。首先，影响我国海洋渔业发展投入要素的选取依据。通过梳理要素投入与经济增长之间的理论，发现劳动力、资本、资源、科技以及制度是经济学家们普遍认同的推动经济增长的重要因素，这为影响我国海洋渔业发展投入要素的选取提供了理论依据。另外，通过探讨投入要素对我国海洋渔业发展的作用，发现劳动力、资本、海洋渔业资源、海洋渔业科技以及海洋渔业制度在我国海洋渔业发展的不同时期都起到了积极作用，这构成了海洋渔业投入要素选取的现实依据。其次，各投入要素对海洋渔业发展的经济效应分析。劳动力、资本、海洋渔业资源、海洋渔业科技及海洋渔业制度对我国海洋渔业发展提供了重要的推动力，本文依据不同投入要素的本质特性，并结合海洋渔业演化发展轨迹，深入分析了各要素投入对海洋渔业发展的经济影响。再次，要素配置扭曲模型的构建和实证分析。在生产函数演化发展的逻辑主线下，找到了适用于海洋渔业的生产函数形式，将影响海洋渔业发展的主要投入要素内生到生产函数中，建立了适用于海洋渔业的生产函数，并从计量角度克服了索罗在推导增长速度方程时将非线性项当做高阶无穷小处理而造成科技贡献率偏高的缺陷，得到了准确的海洋渔业增长速度方程，在此基础上，通过考虑各投入要素的使用成本或机会成本，建立了一个在海洋渔业科技和海洋渔业制度不变条件下的要素配置扭曲模型。收集整理海洋渔业相关数据，利用Eviews6.0统计软件，通过测算我国11个沿海省份海洋渔业要素投入增长率、要素产出弹性与其贡献度间的匹配程度，证实了我国海洋渔业要素投入存在错配现象，在此基础上，进一步利用要素配置扭曲模型得到要素配置扭曲程度以及消除这种扭曲之后我国海洋渔业效益的增加空间。最后，从要素合理配置的市场机制和政府调控机制两方面探讨了我国海洋渔业要素优化配置的实现机制，并从并劳动力、资本、海洋渔业资源、海洋渔业科技以及海洋渔业制度建设五个方面给出了我国海洋渔业要素优化配置的保障措施。