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目的：对贵州省雷山、荔波（布依族、苗族、水族为主）自然人群进行乙型肝炎病毒（hepatitis B virus, HBV）感染筛查，对其中 HBV感染者进行人类白细胞抗原（human leucocyte antigen, HLA）-DP、-DQ、-C基因上的5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点的等位基因及基因型分布研究，探讨贵州雷山、荔波地区多民族自然人群5个 SNPs位点多态性与 HBV感染及感染后病毒的清除之间的相关性。 方法:根据《慢性乙型肝炎防治指南》的诊断标准结合乙肝血清学检测指标、肝生化指标及乙肝血清学病毒核酸(HBV DNA)定量结果对研究对象进行 HBV感染筛查，选择所有 HBV感染者261例和 HBV自限性感染恢复者143例、符合要求健康对照个体152例作为 HLA基因多态性与 HBV感染关联性研究的研究对象（其中布依族289例、苗族174例、水族67例、其它民族26例）。采用 Taq-Man MGB探针法对上述研究对象的5个 SNPs位点（ HLA-DPA1 rs3077、HLA-DPB1 rs9277535、HLA-DQB1 rs9275319、HLA-DQB2 rs7453920、HLA-C rs3130542）进行基因分型，DNA测序验证。SPSS19.0软件对分型结果进行关联分析， Haploview4.1软件进行单倍型分析。 结果：①雷山、荔波1653例个体的 HBV感染筛查结果显示，荔波人群 HBsAg阳性率（10.15％）明显高于雷山（5.83%），差异有统计学意义（P<0.05）。45～59岁人群中 HBsAg阳性率在高于10～17岁人群、60岁及60岁以上人群，差异有统计学意义（P<0.05）。②两人群中携带 rs9277535 AA+AG基因型与 HBV患病风险降低有关（ P=0.033, OR=1.487,95% CI:1.105～2.177）；携带 rs9275319 GG+AG基因型、rs7453920 AA+AG基因型与 HBV感染后病毒的清除存在相关性（ P=0.002, OR=2.539,95% CI=1.395～4.621; P=0.011, OR=0.349,95% CI=0.161~0.758)。③雷山人群中， rs7453920 A等位基因频率在 HBV感染组（2.11%）与 HBV自限性感染恢复组（7.81%）间差异有统计学意义（P<0.05）；男性携带 rs9275319 AG+GG基因型、女性携带 rs3077 TC+TT基因型与 HBV感染后的病毒清除有关（ P=0.026, OR=0.012,95%CI=0.001~0.237; P=0.006, OR=0.178,95%CI=0.05~0.632）。④荔波人群中，携带 rs3077 TT+TC基因型与 HBV感染后的病毒清除有关（P=0.049, OR=1.619,95%CI=1.035~2.805）；携带 rs9277535 AA+AG基因型与 HBV感染风险降低有关（ P=0.042, OR=0.66,95%CI=0.409~0.996）。男性携带 rs3077 TC+TT基因型、rs9277535 AA+AG基因型与 HBV感染风险降低有关（ P=0.008, OR=2.231,95%CI=1.124~4.427;P=0.010, OR=0.439,95%CI=0.206~0.937）。⑤与 HBV感染/清除可能有关的4个 SNPs位点（rs3077、rs9277535、 rs9275319、rs7453920）构成的各单倍型频率在两人群各组间差异无统计学意义（P>0.05）。⑥雷山、荔波两个人群中，rs3130542位点等位基因及基因型频率分布差异有统计学意义(P<0.05)，但其多态性与 HBV感染及清除均不存在相关性。 结论：①贵州雷山少数民族地区 HBsAg阳性率低于全国平均水平，而荔波少数民族地区则高于全国平均水平。②贵州雷山、荔波地区少数民族人群携带 HLA-DPA1 rs3077T、HLA-DPB1 rs9277535A等位基因可能降低HBV感染风险，且荔波人群更为显著，该相关性存在性别差异。③贵州雷山、荔波地区少数民族人群携带 HLA-DQB1 rs9275319 G、HLA-DQB2 rs7453920 A等位基因可能与HBV感染后病毒自发清除有关，且雷山人群更为显著，该相关性存在性别差异。④ HLA-C基因 rs3130542位点多态性与贵州雷山、荔波地区少数民族人群 HBV感染/清除不存在相关性。