促肝细胞生长素(Hepatocyte growth-promoting factors,PHGF)是我国第一个一类生化新药,从新鲜乳猪肝脏中提取纯化制备所得,由一些多肽类活性物质混合组成,在肝炎和肝硬化等重大疾病治疗方面得到了很好的临床应用。到目前为止,促肝细胞生长素仍然是肝脏疾病治疗的重要关键药物,其制备方法和生产重现性控制方面也做了进一步的改良改进。但是,该药物中含有的蛋白质种类和多肽序列,以及它们的相对丰度和所占比重等信息仍然是未知的,尤其是起关键作用的有效成分还没有得到进一步研究和确证,其药代动力学参数也没有进行相关研究,药物生产的质量标准和可控性也欠佳。因此,本研究首次采用先进的蛋白质组学研究方法,基于液质联用串联质谱技术,对促肝细胞生长素药物中的蛋白质/多肽类成分做进一步的质谱鉴定和信息分析,旨在得到促肝细胞生长素药物中实际的蛋白质以及多肽序列、相对比重、以及相关功能和代谢通路分析,提供可与临床药理药效结合分析讨论的重要理论数据支持,为肝脏疾病的进一步药物治疗改进提供可能的理论机制基础,并为该药物的进一步研究和生产改进提供重要的参考和指导。通过液质联用串联质谱(LC-MS/MS)的蛋白质组研究分析,在促肝细胞生长素药物中共鉴定到了152个重要蛋白多肽物质,这些物质在之前的促肝细胞生长素研究中从未报道过,包括一些丰度相对较高蛋白质,如血红蛋白、苹果酸脱氢酶、过氧化氢酶、果糖-1,6-二磷酸酶、半胱氨酸S-甲基转移酶、肝脏羧酸酯酶、乙醛脱氢酶、环氧化物酶、ATP合成酶α亚基等重要功能蛋白质,这些蛋白质的性质都与促进肝细胞生长有着直接密切的关系。其他相对低丰度的蛋白质多肽也很可能是重要的活性调节因子,共同协调了促肝细胞生长素药物的治疗效果。通过进一步的功能注释聚类分析,大量鉴定到的蛋白质与电子载体活性、蛋白质结合、核糖体结构组成、亚铁血红素结合、黄素腺嘌呤二核苷酸结合、脂肪酰辅酶A结合、琥珀酸脱氢酶活性、poly-A RNA结合、NADP结合等相关的重要分子功能。KEGG Pathway注释聚类分析得到抗生素生物合成、碳代谢、新陈代谢、三羧酸循环、氨基酸生物合成、丙酸代谢、半胱氨酸和甲硫氨酸代谢、糖酵解/糖异生、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸降解、脂肪酸降解等相关的重要代谢通路。这些聚类富集得到的蛋白质分子功能和参与代谢通路都是直接与促进肝细胞生长潜在机制密切相关的,为促肝细胞生长素药物调节机制研究提供了重要的理论基础,同时也为促肝细胞生长素药物的进一步认识、生产改进、分子药代动力学研究、药物质控、给药用药方法调整等方面提供了重要参考数据支持。另外,该研究结果表明,采用高通量高精度蛋白质组学研究方法对蛋白质多肽类药物进行研究分析是一套新型高效的研究方式,可为后续更多重大疾病的治疗和药物开发、生产打下坚实的基础。