【摘 要】
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微生物作为生态系统重要组成部分,在系统的物质循环和能量流动等方面发挥着举足轻重的作用。目前关于土壤中可培养微生物不足1%,沙漠土和盐碱土则更少。本课题组先前从采自内蒙古的沙漠土和盐碱土中筛选了3株藤黄色单胞菌属（Luteimonas）菌株,分别命名为SJ-16T、SJ-9T和SJ-92T,这些菌株与现有菌株的16S rRNA基因的相似性较低。本研究采用多相分类方法对它们进行了鉴定。为深入了解这三个
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微生物作为生态系统重要组成部分,在系统的物质循环和能量流动等方面发挥着举足轻重的作用。目前关于土壤中可培养微生物不足1%,沙漠土和盐碱土则更少。本课题组先前从采自内蒙古的沙漠土和盐碱土中筛选了3株藤黄色单胞菌属（Luteimonas）菌株,分别命名为SJ-16T、SJ-9T和SJ-92T,这些菌株与现有菌株的16S rRNA基因的相似性较低。本研究采用多相分类方法对它们进行了鉴定。为深入了解这三个新种,本文分析了它们的单菌株基因组特性,并分析了它们所在属（藤黄色单胞菌属）的基因组特征。结果表明,菌株SJ-16T、SJ-9T和SJ-92T之间的16S rRNA基因序列相似性为96.6-98.4%,菌株SJ-16T与L.chenhongjianii 100111T和L.terrae THG-MD21T的16S rRNA基因序列相似性最高,分别为98.8%和98.6%;菌株SJ-9T与L.marina FR1330T的16S rRNA基因序列相似性最高,为97.9%;菌株SJ-92T与L.aestuarii B9T的16S rRNA基因序列相似性最高,为98.4%。菌株SJ-16T、SJ-9T和SJ-92T分别与现有模式菌株L.chenhongjianii 100111T、L.marina FR1330T和L.huabeiensis HB2T的ANIb值最高,分别达到80.9%、84.4%和80.3%,这些值均低于同种菌株之间的ANI阈值（95-96%）;分别与现有模式菌株L.terrae THG-MD21T、L.marina FR1330T和L.huabeiensis HB2T的d DDH值最高,分别达到37.5%、39.2%和26.4%,这些值也均低于同种菌株之间的d DDH阈值（70%）。三株菌的主要脂肪酸均为iso-C15:0和Summed Feature 9(C16:010-methyl and/or iso-C17:1ω9c);主要极性脂是双磷脂酰甘油脂（DPG）、磷脂酰甘油脂（PG）和磷脂酰乙醇胺（PE）。据此,将菌株SJ-16T、SJ-9T和SJ-92T分别鉴定为Luteimonas属的3个新种,分别命名为沙漠藤黄色单胞菌（Luteimonas deserti sp.nov.;模式菌为SJ-16T）、喜盐藤黄色单胞菌（Luteimonas saliphila sp.nov.;模式菌为SJ-9T）和盐土藤黄色单胞菌（Luteimonas salinisoli sp.nov.;模式菌为SJ-92T）。菌株SJ-16T、SJ-9T和SJ-92T的基因组大小和DNA G+C含量分别为约3.7 Mb、4.6 Mb、4.5 Mb和69.3%、69.3%、70.4%。它们都可以通过糖酵解途径将葡萄糖或果糖转化为乙酰辅酶A进入三羧酸循环。它们的基因组中主要含有糖苷水解酶和糖基转移酶等糖类活性酶,编码芳基聚烯烃簇和套索肽簇等多个次级代谢产物合成基因簇。三个新种通过合成接触酶及时清除活性氧分子,合成海藻糖平衡渗透压,使用Hsp90分子伴侣辅助蛋白折叠,通过Crp系统调控菌株基因转录等方式提高自身适应极端环境条件的能力。该属含有一些疾病相关基因可能为人类抗争疾病创造基因组工具。这些为今后更好地了解藤黄色单胞菌属提供了参考依据。
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