小麦苗期抗旱性的GWAS分析及综合评价

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yishu888
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小麦(Triticum aestivum L.)抗旱性是由多基因控制,GWAS分析可以使得自然群体中的多个等位基因同时被检测,具有耗费低、精确度高、实用性强等优点。本研究试验材料是158份小麦品种群体(系),对14个抗旱相关性状进行测定,利用114777个SNP分子标记进行全基因组关联分析,结果如下:1.变异分析和相关分析14个性状的变异系数范围是8.37%-30.90%,平均值为16.07%。除正常水分下的根表面积(RSA)外其他性状的变异系数均大于10%,变异较大。14个抗旱相关性状的相关性分析表明,在两种水分条件下,苗鲜重、根鲜重、总鲜重、苗干重和根干重两两之间互为极显著正相关。在干旱胁迫条件下,苗鲜重、根鲜重、总鲜重、苗干重、根干重、总干重和总根长与D值均呈极显著正相关。2.抗旱种质资源评价主成分分析结果显示,前6项主成分累积贡献率达86.24%,分别是生物产量,根的生长,根的物质积累和苗高。而生物产量、根系生长情况和根物质积累作为贡献率最高的前3项,可成为鉴定小麦苗期抗旱性的重要参考指标。对小麦苗期抗旱相关性状进行综合评价,根据D值对各小麦品种进行筛选,利用K值聚类法将D值分为5类,将小麦的抗旱性分为高敏感(0.28-0.40)、敏感(0.41-0.48)、中等(0.49-0.57)、抗旱(0.57-0.68)和高抗旱(0.71-0.81)5个等级。3.GWAS分析利用114777个SNP标记对小麦苗期抗旱的相关性状和抗旱系数进行关联分析,在P≤0.0001的水平上共检测到1052个分子标记,其中47个与相关性状稳定关联的位点,单一位点有92个,占总位点的8.75%,贡献率(R~2)范围为8.49%-23.77%,均值为13.61%。共检测到27个多效位点,分布在1A、1B、2A、2B、3A、4B、5A、7B和7D染色体上。在2A染色体上检测到多效位点SNP106243与5个性状(苗鲜重、根鲜重、苗干重、根干重和根表面积)显著关联,在5A染色体上检测到SNP310710与5个性状(苗鲜重、根鲜重、根鲜重、苗干重和总干重)显著关联。在5A染色体上检测到的与苗鲜重稳定关联的位点SNP310710(5A)可以在DA、C2和D2环境下检测到,且贡献率(R~2)最大,均超过10%,是主效位点。
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