紫茎泽兰(Ageratina adenophora)是一种危害严重的入侵性杂草,大概于20世纪40年代从滇缅边境入侵至我国云南省南部,现已在中国西南部地区广泛分布。道路廊道对紫茎泽兰的传播具有通道效应,促进其沿道路廊道快速扩散,对生态造成了严重影响。本文以道路沿线的紫茎泽兰为研究材料,以滇缅公路和云南省内213国道沿线区域,以及缅甸、贵州、广西、四川与云南的交界区域作为研究区,利用RAD-seq技术对研究区内39个紫茎泽兰种群的基因组结构进行分析,以揭示道路廊道对紫茎泽兰种群基因组结构的影响,并推测其在我国定居扩散的历史过程。研究结果概括如下:(1)云南省道路密度和连通度普遍较低,无道路分布和低密度区域占云南省总面积的83.3%。云南省的路网分布不均匀,中东部地区的道路密度整体高于西部地区和南部地区,其中昆明市、曲靖市、玉溪市的道路密度最高。(2)39个紫茎泽兰种群共181个体的核DNA经简化基因组测序后,共获得125.88百万序列(MReads),分析发现264375个SNPs。种群遗传多样性统计分析结果显示,多态性位点百分比(PPB)平均值为64.56%(52.17%～68.46%),预期杂合度(He)、等位基因平均频率(P)、核苷酸多样性(Pi)平均值分别为0.2564、0.7855和0.2958。紫茎泽兰种群的遗传多样性与经度、道路密度具有显著性负相关关系。(3)种群间的遗传分化系数FsST和基因流(Nm)平均为0.0397和6.16,种群内遗传分化系数Fts平均为-0.24,种群间的遗传分化较小,基因流强烈。PCA和Admixture分析表明,紫茎泽兰种群的亲缘关系较近,无明显的种群遗传结构。Mantel分析显示,紫茎泽兰种群的遗传分化和空间距离的相关性不显著。道路廊道促进了种群沿路扩散,距离隔离效应对紫茎泽兰种群基因组水平的遗传多样性无显著影响,距离隔离效应小于景观连通效应。