双成分网络模块的建模与动力学行为分析

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由于真实的生物调控网络过于复杂,无论是定性还是定量分析都很难操作。研究那些大量存在于生物系统中,相对独立且具有特定生物功能的调控网络模块的结构与功能就变得可行且有意义,并且可以对真实复杂网络可能出现的现象做出初步的分析和预测。  本文从两个成分构成的网络模块出发,对几个典型的双成分网络模块建模并对其进行输入输出信号响应以及动力学行为变化做详细分析。由于双成分网络模块在真实生物中的广泛存在性,我们着重讨论真实存在的p53-Mdm2反馈环。利用相关实验背景下的数据,快平衡近似以及质量作用定律建立数学模型,借助分支软件XPPAUT和数学软件MATLAB,详细分析了模型的关键参数对系统动力学行为的影响。我们发现即使是简单如双成分网络,可以使得系统出现单稳、双稳以及振动等多种动态行为之间转换,充分说明了网络模块的不同动力学功能及其对整个网络行为出现的重要作用。这些分析结果对生物实验的结果有很好的解释意义,并有可能对生物实验提供理论指导。
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