温州模式研究是当前学术界特别是经济学界的一大热点。随着温州经济、社会的进一步发展，一些非经济问题或难以用经济学分析方法研究的经济问题日益显现，特别是温州商会的兴起。温州商会的兴起预示着国家—市场—市民社会这一新的权力格局正在形成，凸显了以往温州模式研究的局限性，温州模式研究亟需从经济学研究范式向政治社会学研究范式转型。 当前我国的市民社会理论正逐步从范式研究转向范例研究。以社团和民办非企业单位为主的第三部门的兴起是我国改革开放以来社会发展的新变化。第三部门的发展为我国市民社会理论提供了范例研究的对象和理论校验的素材，使得市民社会获得经验上的支持，第三部门已成为我国市民社会研究的重要题域。温州商会正是这一题域的典型对象。 以民间化取向发展的温州商会与政府、企业间的合作与互动，可以为我国第三部门的发展提供借鉴。但同时，温州商会的发展也面临着诸多困境，一是角色模糊，存在较强烈的营利倾向；二是政治化色彩仍显浓厚；三是组织发育的不足；四是主管部门的分散与业务体制的不顺。这些困境集中反映了商会的合法性问题，某些合法性不足正成为商会发展乃至我国第三部门发展的障碍。最后，以实现良性合作与互动的新型国家与社会关系为目标，对这些问题提出可能的解决方案。