四种海藻热休克蛋白70(HSP70)基因的克隆与表达分析

来源 :中国科学院海洋研究所 | 被引量 : 11次 | 上传用户:liongliong561
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
热休克蛋白70是热休克蛋白家族中重要的成员,参与新生蛋白的折叠、转运、重折叠变性蛋白、协助降解变性蛋白和抗逆环境胁迫等功能。海带和裙带菜是浅海潮下带典型的褐藻,孔石莼和浒苔是潮间带典型的绿藻,四种大型海藻均有重要的经济价值和生态价值。随着潮汐变化固着藻类生境理化因素变化剧烈,藻类面临着严重的环境胁迫,因此研究藻类抗逆机理有着重要的意义。   本研究采用同源克隆法配合RACE-PCR,克隆了海带、孔石莼、裙带菜和浒苔HSP70基因的全序列(分别命名为LJHSP70、UPHSP70、QDHSP70和EPHSP70)。利用生物信息学方法分析了四种藻类HSP70结构特征、同源性关系和进化地位。获得的海带HSP70基因全序列长为2918 bp,5’非翻译区为248 bp,3’非翻译区为696 bp,开放阅读框为1974 bp,编码657个氨基酸,预测的分子量为72.03 kDa,等电点为4.97。获得的裙带菜HSP70基因全序列长为3243 bp,5’非翻译区为248bp,3’非翻译区为1021 bp,开放阅读框为1974 bp,编码657个氨基酸,预测的分子量为72.03 kDa,等电点为4.96。获得的孔石莼HSP70基因全序列长为2283 bp,5’非翻译区为65 bp,3’非翻译区为247 bp,开放阅读框为1971 bp,编码656个氨基酸,预测的分子量为71.13 kDa,等电点为5.04。获得的浒苔HSP70基因全序列长为2265 bp,5’非翻译区为65 bp,3’非翻译区为217 bp,开放阅读框为1983 bp,编码660个氨基酸,预测的分子量为71.39 kDa,等电点为5.03。四种海藻HSP70氨基酸序列均含有四肽重复序列GGMP,具有三个典型的HSP70签名基序。细胞质定位的HSP70 C.末端特征基序为EED或EEVD,并且N-端氨基酸序列保守性高于C-端。海带和裙带菜HSP70蛋白同源性为98%,孔石莼和浒苔HSP70蛋白同源性为96%,四种海藻HSP70蛋白序列与陆地植物和其他藻类HSP70蛋白序列同源性为70-80%。   利用荧光定量RT-PCR技术对不同胁迫条件处理的海带和孔石莼HSP70mRNA的表达水平进行定量分析。不同热激温度(5-40℃)处理组中,30℃处理组的海带HSP70 mRNA表达量最高是10℃处理组的海带HSP70 mRNA表达量的3倍,而35℃或40℃处理组的海带HSP70表达量却低于25℃或30℃处理组的海带HSP70 mRNA表达量。25℃不同热激时间(0-12h)处理组中,海带HSP70 mRNA表达量呈先上升后下降趋势。热激1h后海带HSP70 mRNA表达量迅速上升,热激7h后mRNA表达量达到最大,是对照组表达量的4倍。不同盐度(O‰-45‰)胁迫处理组中,O‰或5‰盐度处理组的海带HSP70 mRNA表达量是30‰盐度处理组海带HSP70 mRNA表达量的3倍。35‰、40‰和45‰盐度处理组之间HSP70 mRNA表达量较低且无显著差异。   不同热激温度(5-40℃)处理组中,20℃或25℃处理的孔石莼HSP70mRNA表达量较低,而5℃、35℃、或40℃处理组的孔石莼HSP70 mRNA的表达量是25℃处理组孔石莼HSP70 mRNA表达量的2倍以上。30℃不同热激时间(0-12h)处理组中,孔石莼HSP70 mRNA表达量也呈先上升后下降趋势。热激5h后孔石莼HSP70 mRNA表达量达到最大,是对照组的3.5倍。不同盐度(0‰-45‰)胁迫处理组中,0‰或5‰盐度处理组的孔石莼HSP70 mRNA表达量是30‰盐度处理组孔石莼HSP70表达量的3倍。30‰、40‰和45‰盐度处理组孔石莼HSP70 mRNA表达量较低,且无显著差异。不同紫外线照射时间(0-4.0h)和不同干燥时间(0-4.0h)处理组中,孔石莼HSP70 mRNA表达量都在3h后达到最高值,之后表达量维持在较高水平。   为进一步研究藻类HSP70的生物学功能,将海带HSP70基因的开放阅读框区域克隆到表达载体pEASY-E2中,并转化到大肠杆菌BL21(DE3)pLysS。将阳性重组子培养于含有AMP(100 U/mL)的LB培养基,IPTG诱导表达,SDS-PAGE电泳鉴定。经5h诱导,其表达量达到平台期,继续培养HSP70表达量并不显著增高。5mM IPTG诱导海带HSP70蛋白表达量高于1mM IPTG诱导蛋白表达量。
其他文献
20世纪50年代以来,我国沿海地区海岸侵蚀问题开始加剧。随着沿海地区经济的迅速发展,人类活动的加剧,海岸侵蚀对沿海地区经济增长的威胁也与日俱增。漠阳江是广东省径流系数
作曲是高校音乐专业中的重要课程,其集各种音乐理论知识之大成,真正实现了从学习和欣赏音乐向创造音乐的转变。长期以来,因为作曲课程自身的特殊性,所以各地各类的高校教学中
从英语新课标的要求来看,其强调英语教师应当注重对学生进行系统的英语阅读教学,以此来帮助学生提升对英语语言知识的领会和理解能力.同时,新课标要求英语教师藉由对学生英语
期刊
太原广播电视台法制频道是山西省唯一的专业法制频道,频道秉承普及法律知识、弘扬法治精神、推进社会主义法制进程的宗旨,创办了《并州之剑》、《百姓说法》、《有话好好说》
热点升温过快,“沸腾”所产生的蒸汽遮盖了人们的眼睛,也遮住了理性思考,使人们看不清事物的本质。这其中,有的是为了引起轰动效应,也存在一些涉及经济利益的因素,但不管出于
随着新课程标准的不断落实,对初中英语教学也提出了新的挑战和要求。传统的教学大纲要求关注知识技能的传授,新课标规定在关注知识技能传授的同时,更要关注学习的过程和方法,
学位
浅蓝霉素是一类有着独特的二联吡啶环结构的天然产物,具有抗真菌和抗细菌的活性,其中的浅蓝霉素A最近还被发现具有开发成为免疫抑制剂的潜力。本研究的目的是克隆和鉴定海洋
党员是党组织的细胞.企业的党员队伍是办好企业的中坚力量。一、国有企业中的共产党员是办好企业的中坚力量企业中的共产党员是企业职工中的先进分子.他们直接参与生产经营活动
高师声乐硕士研究生的培养是为我国声乐教育提供高层次的专业型人才,然而因为各高师院校因课程设置、教材建设等没有达成统一的目标,造成高师声乐研究生培养的目标、成果参差