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大豆是我国最早的经济作物之一。近年来,由于市场供求关系的变化,国内大豆进口数量呈现强劲增长势头,导致大豆栽培面积不断扩大,连作现象越来越普遍,大豆产质量呈现逐步下滑趋势。黑龙江省是中国大豆主产区,连续近几年大豆连作面积达到了 50%～70%。连作导致的大豆根腐病等土传病害不断加重,而人们对如何克服连作障碍却一直没有得到很好解决。AM真菌对植物的抗逆性具有显著的促进作用,本试验主要是对连作大豆接种F.moseae,分析连作大豆根际土壤根腐病病原真菌菌群结构的变化,探究F.mosseae对大豆根腐病致病真菌的影响,为利用AM菌剂预防大豆根腐病发生提供理论基础,所以,本项研究对解决大豆连作障碍具有十分重要的意义。本试验采用PCR-DGGE技术分析3个大豆品种在根腐病高发期根际土壤及根系中根腐病致病真菌菌群结构,通过DGGE图谱分析得出:不同连作年限每个品种不同生育期根系和根际土壤病原真菌的总丰度值、优势度、多样性指数降低,且连作2年大于连作1年,菌群结构更加复杂;不同连作年限3个品种不同生育期中,大豆HN48的根系和根际土壤病原真菌总丰度值、优势度、多样性指数最高,HN48>KF16>HN44,且不同大豆品种优势菌群不同。连作种植的大豆根系及根际土壤的DGGE谱图中共包含有13条谱带,分别有终极腐霉菌(Pythium ultimum)、镰胞菌属(Fusarium sp.)、格孢腔菌(Pleosporales sp.)、立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)以及七种未培养的真菌。对13条条带测序结果:优势根腐病病原真菌主要分为,终极腐霉菌(Pythium ultimum)、立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)。从系统发育树的亲缘关系来看,七种未知的真菌也都与这两类病原真菌有较近的亲缘关系。