我国自上世纪90年代中期起实施科教兴国战略,科技和教育事业作为国家发展的重点受到各级政府的高度重视,高校作为国家科技和教育体系的重要组成部分,在各类研究和试验发展方面,都担负着重大的责任和使命。自2011年起,相关的科研经费管理制度与法规体系逐步完善,这促进了在科研领域的经费管理深化改革,同时提升了高校科研经费的审计标准。当前我国各高校普遍面临着科研经费管理体制与科技投入快速增长不适应的难题,这也就导致了在高校科研经费领域的审计弊病逐渐显现。建立切实可行、显效明显的经费审计体系则显得尤为重要,因此为了使得高校科研经费发挥更大的作用,从而更好的推动科技创新与科技进步,需要着重对于高校经费的管理工作进行系统性提升,其中尤以科研经费审计为重中之重。本文以A高校为样本,对其科研经费审计进行了案例分析,首先对高校科研经费审计进行了范围界定,分析了某些发达国家的做法,然后介绍了A高校的基本情况,着重阐述了A高校现阶段科研经费的管理现状以及审计体系,并分析了其所存在的审计问题,进而得出了现阶段A高校的科研经费审计目前主要有以下五个问题:一是科研经费的审计制度及实务操作规范不够完整,二是科研经费审计力量不足,三是科研经费审计与科研项目经费管理的结合有待提高,四是审计工作方式方法不适应信息化时代的要求,五是审计结果未进行相应的公开且其结果未被有效利用。针对发现的问题,本文从审计视角为改革和完善A高校科研经费审计提供如下对策:完善审计制度的规范化建设;改良现有的组织结构增强审计力量建设;结合科研实际安排审计任务和开展审计工作;利用信息化手段创新科研经费审计工作的方式方法;充分利用审计结果提升科研经费的管理效率,本文希望这些建议措施可以帮助高校提升审计效率,实现科研经费的有效管理与科学利用。