萝卜(Raphanus sativus),属于十字花科萝卜属,是一种非常重要的食用和保健蔬菜,其营养极其丰富。对萝卜种质资源的遗传多样性进行研究,有利于萝卜种质的鉴定、创新以及有效利用。硫代葡萄糖苷有重要的生物活性,开展萝卜种质资源的硫代葡萄糖苷研究工作,对萝卜的育种工作有重要的指导作用,也可为阐释萝卜药用机理提供新思路、新证据。硫代葡萄糖苷标记从植物化学水平反映萝卜材料间的遗传差异,是研究萝卜种质资源的遗传多样性和亲缘关系的新方法,拓展了植物化学在植物种质资源研究中的应用。本文主要采用了形态标记和硫代葡萄糖苷标记,运用系统聚类分析法和主成分分析法,研究了127份萝卜种质资源的遗传多样性和亲缘关系。主要研究结果为:1.利用高效液相色谱-质谱(HPLC-MS)联用法分离鉴定出萝卜种质中含有8种硫代葡萄糖苷,并对叶片和肉质根的硫苷组成和含量进行了分析。表明三个萝卜品种的叶片和肉质根的硫苷组分相同,但含量存在显著差异。2.对萝卜种质的10个植物学形态性状进行了鉴定和分析,结果表明其平均多样性指数为0.70。利用形态标记可把127份萝卜种质分为4类。主成分分析结果表明,利用形态性状对萝卜种质分类时,首先考虑的是根的性状,其次是颜色,最后是叶的性状。3.利用硫代葡萄糖苷标记对127份萝卜种质进行了系统聚类分析,结果将供试材料分成了4类,主成分分析也将其分为4类,两种分类方法的结果基本保持一致。主成分分析中前三个主成分的累积方差贡献率达到了89.74%。4.对形态标记和硫代葡萄糖苷标记之间的相关性进行了卡方检验,硫代葡萄糖苷标记和形态标记之间的相关系数范围为0.208~0.241。5.综合两种标记方法的分析结果可看出,无论是从植物学形态性状还是从硫代葡萄糖苷标记分析,其聚类结果都离不开形态性状,与形态特征相关。最终分析结果可将127份萝卜种质分为3类:长根型萝卜、短根型萝卜和扁圆形萝卜。