本研究主要通过利用微卫星分子标记对来自野生大豆分布区域的野生大豆[Glycine soja Sieb.et Zucc.]和栽培大豆[Glycine max(L.)Merri.]地方种进行遗传多样性、遗传结构以及系统进化分析,主要结论如下:　　 1.对来自野生大豆物种分布区的野生大豆和栽培大豆地方种代表性样本进行分析。遗传多样性结果表明中国南方为栽培大豆和野生大豆的遗传多样性中心。同时对栽培大豆和野生大豆遗传多样性进行比较发现,虽然期望杂合度没有很大的降低,但是等位基因丰富度和私有等位基因位点大大减少,表明在栽培大豆的驯化过程中经历严重的遗传瓶颈。　　 2.对所有栽培大豆地方种和野生大豆样本利用这56个标记位点进行系统进化分析、STRUCTURE2.0的分配分析以及前面的遗传多样性中心的结果,推测栽培大豆可能单起源于中国南方。　　 3.对我国栽培大豆地方种和野生大豆进行全基因组水平上长距离范围的连锁不平衡进行分析,发现栽培大豆作为一种高度自花授粉的物种,与其他白花授粉作物相比并没有表现出期望的高连锁不平衡水平；比较野生大豆,栽培大豆表现出了更高的连锁不平衡水平。　　 4.4.对我国范围内40个野生大豆居群进行遗传多样性及系统地理学分析。结合遗传结构以及系统地理学分析我们提出了东亚两条可能的野生大豆扩散途径。