玉米籽粒胚乳突变体基因ZmKFM1的精细定位

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灌浆是光合产物从叶肉细胞经韧皮部长距离运输至籽粒并积累的生物过程。胚乳的发育与灌浆过程相关,进而影响籽粒百粒重和产量。前人从不同角度对玉米灌浆的遗传机制进行了研究,定位了玉米籽粒灌浆QTL,并克隆了多个籽粒灌浆的相关基因,但揭示玉米籽粒胚乳发育的遗传机制需要相关基因的克隆和调控网络的构建,玉米胚乳突变体的研究为这一过程的实现奠定了基础。本研究以课题组在育种过程中发现的籽粒胚乳突变体M72为基础材料,采用图位克隆技术,对控制该突变体性状基因进行了精细定位和候选基因预测,结果如下:1.胚乳突变体M72的表型分析突变体M72表现为籽粒灌浆差,突变体胚乳细胞在大小上与正常材料的胚乳细胞没有明显变化,但在淀粉粒上出现较多孔洞,种皮透明。成苗率较低且苗期长势较弱,经过大喇叭口期生长较为迅速,生育期比正常材料长8-10天,能正常散粉结实。成株表型正常。2.胚乳突变体M72的遗传分析突变体M72与常规自交系B73杂交组配F1表型与B73相同,F2和BC1分离群体的表型经卡方检验后分别符合3:1和1:1的分离比,说明该突变性状由单隐性基因控制。3.突变体性状控制基因的精细定位与候选基因预测通过BSA分池方法筛选覆盖玉米全基因组的800对SSR标记,将候选基因ZmKFM1初步定位于第2染色体的2.04bin。经过小群体验证,将目标基因定位在标记umc1485和umc2252之间。利用7万株BC1分离群体,结合碱煮快速DNA提取法筛选到1270个发生交换的籽粒。进一步利用B73参考序列在候选区段内开发了600对SSR标记,其中19对有多态性。利用这些多态性引物对已筛选到的交换单株进行标记分析,最终将候选基因ZmKFM1定位于标记12.22-63和8306之间,物理距离为135.6kb。
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