基于网络方法的急性缺血性脑卒中神经保护与损伤修复相关潜在靶点和药物预测

来源 :大连医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jwk000
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
AIS(Acute Ischemia stroke,急性缺血性脑卒中)是由血栓形成或栓塞,系统灌注不足导致大脑血流受限,细胞缺血缺氧,进而导致大脑细胞死亡。具有高发病率、高死亡率、高致残率以及高复发率等特点。是人类主要死亡原因之一,也是患者致残的最主要因素。急性缺血性脑卒中的发病是由环境、遗传等多个因素引起,是多基因参与的复杂疾病,其发病过程中涉及兴奋毒性、氧化应激、脂质过氧化和炎症反应等多个病理生理学过程。而目前临床对急性缺血性脑卒中治疗,多局限于溶栓和抗凝治疗,疗效较差,造成死亡、残疾以及大量的社会财力和物力流失。过去的研究中,许多药物在急性缺血性脑卒中的实验研究中表现出较好的神经保护作用,但是却不能成功地应用于临床治疗。因此新的有效的神经保护及损伤修复相关药物的研发势在必行。传统药物的研发,多依赖于基因产物与特殊表型之间直接的因果关系,研发的药物多作用于特定靶点。新药多倾向于与已知的靶蛋白结合,增加靶蛋白网络中已存在蛋白之间的联系。近年来在药物研究发展过程中同时出现两种趋势:第一是以症状为基础的疾病分类系统转换为以分子为基础的分类系统。第二是作用于单一分子的研发模式转变为作用于多种分子、通路或网络的研发模式。多向药理学指出“一药多靶,多药一靶”的药物作用方式,为复杂疾病药物研发提供新的途径。且近几年网络医学的迅速发展为复杂疾病的研究提供了一个基于网络的模型,有助于疾病基因及其产物的全局功能研究,有利于更好的研究疾病(尤其是复杂疾病)的分子机制,更好地识别疾病基因和生物学路径,为药物研发提供更好的靶点。本研究将在网络医学基础上,利用现有的医学数据库、PPI(Protein-Protein Interaction,蛋白质相互作用)网络、计算机算法和相关分析软件,对急性缺血性脑卒中相关基因/蛋白的相互作用进行全局性的研究,寻找与急性缺血性脑卒中治疗相关的潜在靶点与候选药物。首先通过在Me SH主题词表中查找和专家认证,确认急性缺血性脑卒中相关的主题词,依据这些主题词查找出疾病相关基因,并通过文献阅读,逐一甄别出可靠的疾病-基因关系,获得可靠的急性缺血性脑卒中疾病基因。将这些可靠基因作为种子映射入PPI网络中。统计其在模块中的分布比例。筛选出有代表性的模块。其次结合现有药物数据库中药物及其靶点信息,利用统计学和网络最短路径计算方法研究并统计疾病基因与药物靶点之间的距离关系。结合GO和Pathway富集度分析,分析模块功能,并筛选出模块重要的Pathway,结合靶点与疾病基因的网络分布关系,从相关模块中筛选出存在于重要Pathway的节点,并通过查找已有的实验研究和文献,确定急性缺血性脑卒中神经保护相关的潜在靶点。依据这些潜在靶点从现有药物数据库中筛选出疾病治疗相关的候选药物。依据以上方法我们对四个模块进行分析,并从其中两个模块,与神经保护相关的Pathway中找到了一些潜在靶点,并找到一些候选药物。其中潜在靶点ADORA3(adenosine A3 receptor)参与重编程及细胞外基质的调节。候选药物中包含其他神经系统疾病治疗药物,例如癫癎治疗药物Felbamate(非尔氨酯)和Methylphenobarbital(甲基苯巴比妥),以及阿尔兹海默症治疗药物Memantine(美金刚)。这些药物在急性缺血性脑卒中治疗中的神经保护作用,还需要更进一步的实验研究。
其他文献
摘要:写作对中学生来说是很宽泛的课程,初中学生容易从生活中找到合乎自身表现的形式,但写作者要能传达出自身对自然、社会、生活的思考和体验,就需要写作者发挥主体精神。因而写作教学是最需要发挥学生主体性的学科,也是最能培养学生主体性的学科。通过观察认识生活,通过阅读扩大见闻。并以发展的眼光去感悟生活,挖掘美,表现美。  关键词:写作;观察;阅读;感悟  主体性写作主要包括写作主体人格结构、写作能力结构和
南水北调西线工程是我国南水北调总体规划“四横三纵”基本构架中的重要组成部分,是从长江上游干支流调水入黄河上游的跨流域调水重大工程,是补充黄河水资源不足,维持黄河健
随着现代网络技术的高速发展,基于网络的信息共享系统在社会各领域正得到越来越多的广泛应用。尤其是地域上较为分散的行业,通过广域网突破时空的限制,构建覆盖各分支机构的科研
钢管混凝土是指在钢管内填充混凝土而形成的组合结构。它利用钢管和混凝土在受力过程中的相互作用,充分发挥两种材料的长处,相互弥补彼此的弱点。它自架设能力强,具有高强、
目前国内外学者对纤维增强塑料(FRP)耐久性及其加固结构的耐久性已进行了一些研究工作,但研究多为对单一FRP复合材料耐久性的研究,而针对混杂纤维增强塑料(HFRP)的研究相对较
在水电站的日常运行过程中,洪水预报为电站的安全经济运行提供了科学的参考信息,特别是当流域发生大强度降雨时,洪水预报工作可以提前计算出以后多个时段的水库入库流量以及洪峰
目的:  1.分析类风湿关节炎(RA)患者肠道特异菌属的菌群结构,探讨RA肠道特异菌属多样性变化和菌群特征,为筛选对RA有调整作用的益生菌候选菌株提供依据。  2.探讨肠道菌群
  仿真模型验证是仿真模型有效的重要保证,目前模型验证辅助工具可扩充性和可重用性较差,将软件工程中模块化设计方法应用到模型验证辅助工具设计中,该工具具备资源管理、模型
转铁蛋白是一种非血红素结合的β-球蛋白,它具有两个铁离子(Fe3+)结合位点,可以结合两个铁离子。多个物种转铁蛋白的结构、功能、序列和表达已有了深入的研究。但是,关于文昌鱼
面对日益严峻的水资源问题,研究区域水资源需求量具有十分重要的理论意义和应用价值。本文针对区域灌溉用水需求问题进行了研究,主要内容有以下几部分:(1)在参阅国内外大量文