论文部分内容阅读
Leptin基因由3个外显子和2个内含子组成,它主要参与动物体重、繁殖功能和机体能量平衡等方面的调节。本研究选用具有优良种质特性的安庆六白、皖南黑猪、皖南花猪、定远黑猪四个安徽地方品种的母猪为对象,研究Leptin基因的单链核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)及其与产仔性状之间的关系。根据GenBank上的基因序列设计3对引物,采用PCR-SSCP技术,对上述四个猪种Leptin基因的第2和第3外显子进行PCR扩增,然后进行聚丙烯酰胺凝胶电泳并测序,期望找出Leptin基因与繁殖性状之间的相关性,从而为猪的育种工作提供分子标记,达到标记辅助选择的目的。经研究发现:1、3对引物中,有2对引物存在SNPs(引物2和引物3),外显子2上无突变,两个突变位点均在外显子3上(T3469C和G3717T)。2、Leptin基因在四个安徽地方猪种的群体遗传分析表明:四个安徽地方品种在引物2上表现出AA、AB、BB3种基因型,经检验该突变(T3469C)属于同义突变,在引物3上表现出CC、CD、DD3种基因型,该突变亦属于同义突变(G3717T)。在T3469C突变位点上,安庆六白AA、AB、BB的基因型频率分别为0.3236、0.5882、0.0882;皖南黑猪3种基因型频率依次为0.3530、0.5686、0.0784;皖南花猪依次为0.2182、0.6182、0.1636;定远黑猪依次为0.3699、0.4795、0.1506。在G3717T突变位点上,安庆六白CC、CD、DD的基因型频率分别为0.4706、0.4706、0.0588;皖南黑猪3种基因型频率依次为0.3333、0.4902、0.1765;皖南花猪依次为0.4182、0.4909、0.0909;定远黑猪依次为0.4521、0.3699、0.1780。卡方检验显示安徽四个地方猪种的基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡,安徽四个地方品种均表现出了丰富的遗传多态性。3、将产仔性状分为最高产仔数(LSP)、头胎产仔数(LS1)和平均产仔数(LSa),方差分析不同位点各基因型之间产仔数的差异,结果表明安庆六白猪Leptin基因的T3469C位点和G3717TC上,三种基因型在最高产仔数性状上差异均显著(P<0.05);皖南黑猪Leptin基因T3469C位点上的三种基因型,在最高产仔数性状上差异显著(P<0.05);皖南花猪Leptin基因G3717T位点上的三种基因型,在最高产仔数性状上差异极显著(P<0.01);定远黑猪在两个突变点上与产仔性状均无关联(P>0.05)。可见,Leptin基因或许是影响猪产仔性状潜在的遗传标记,可以应用于猪育种工作中的标记辅助选择,但有的基因型的样本数较少,可能会给结果带来一定影响,需要增加样本数做进一步的研究验证。