研究目的:研究二代测序检测乳腺癌(breast cancer,BC)PIK3CA,TP53,PTEN基因状态和肿瘤异质性,并探讨突变的临床意义,为乳腺癌的治疗踏入精准治疗打下理论基础。研究方法:取2015年7月至2018年12月苏州大学附属第一医院的81例乳腺癌患者的肿瘤组织。肿瘤组织经石蜡包埋切割后,使用基于二代测序技术(Next-generation sequencing)的108基因panel对PIK3CA,TP53,PTEN这三个突变率最高的基因全部外显子区域进行基因状态检测,分析这三个基因中出现的突变、缺失、拷贝数增加等基因变异事件,再结合患者年龄、雌孕激素水平(ER、PR)、人类表皮生长因子受体2(HER-2)、Ki67、组织学分级、TNM分期等病理及临床资料进行分析。结果:(1)在81例乳腺癌标本中,PIK3CA基因突变47例,突变率为58.02%,TP53基因突变49例,突变率为60.49%;PTEN基因突变9例,突变率为11.1%。81例患者中,以上三个基因总突变率为87.65%。其中以PIK3CA和TP53基因突变率最高,因此可认为这两者是乳腺癌的驱动基因。(2)根据患者激素受体状态、HER-2表达状态和Ki67的表达,把乳腺癌分为Luminal A,Luminal B,HER-2过表达和TNBC四种分子亚型。临床诊断和组织学分级以浸润性导管癌和WHOⅡ级为主。PIK3CA突变患者中Luminal A型22人(46.8%),Luminal B 型 6 人(12.8%),HER-2 过表达 16 人(34.0%),TNBC 型 3 人(6.4%)。TP53 突变患者中,Luminal A 型 14 人(28.6%),Luminal B 型 6 人(12.2%),HER-2过表达19人(38.8%),TNBC型10人(20.4%)。PTEN突变患者中,Luminal A型0 人(0%),Luminal B 型 3 人(33.3%),HER-2 过表达 3 人(33.3%),TNBC 型 3人(33.3%)。(3)PIK3CA突变全部表现为错义突变(Missense mutation)这一种单一形式。TP53突变表现为错义突变,无义突变(Nonsense mutation),剪切突变(Shear mutation),截短突变,移码突变,其中错义突变为主,为28例,达到57.1%。PTEN突变表现为错义突变,截短突变,移码突变,其中截短突变为主(55.6%)。(4)PIK3CA基因突变率与乳腺癌患者相关临床病理因素无明显相关。TP53基因突变率与乳腺癌患者的年龄、肿瘤大小、TNM分期等也并无关联,但是ER阴性或PR阴性或HER-2阳性的患者更容易出现TP53基因突变(p分别为0.001、0.002和0.028);组织学分级高的患者更易伴随TP53突变(p为0.000);Ki67大于15%的患者更容易伴随TP53突变(p为0.022)。PTEN基因突变率与PR阴性有关(p为0.025)。PIK3CA,TP53,PTEN各自基因突变率与其他两个基因是否突变无关。TP53兼PIK3CA突变者结局较差。结论:乳腺癌有着不同的组织学与病理学特征,具有复杂的分子生物学特征,有多样的遗传突变。TP53突变发生率与ER或PR阴性、组织学分级较差、Ki67较高有关,提示预后较差。TP53兼PIK3CA突变者结局较差。二代测序作为近两年发展起来的一种比较先进的测序方法,可有效筛选乳腺癌相关基因突变,为临床医生提供有效信息,由此促进乳腺癌迈入精准治疗,改善患者预后。