延边黄牛肉质候选基因标记效应及表达分析

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本试验选取70头延边黄牛公牛为试验材料,采用直接测序和PCR-RFLP技术对ANGPTL4、FABP4、PLIN基因的SNP位点进行了检测,并与延边黄牛肉质性状进行了相关性分析。在FABP4基因5个连锁不平衡位点的不同基因型个体中对FABP4、PPARγ、ANGPTL4、LPL进行了表达分析。以期筛选出与延边黄牛肉质性状显著相关的功能基因或分子标记。试验结果如下:1.ANGPTL4基因存在呈中度多态的2个SNP位点。41687 bp C→T位点与测定的延边黄牛肉质性状未发现相关性;41995 bp C→T位点与延边黄牛脂肪含量、蛋白含量、胴体重、大理石花纹呈显著相关性,表现为:CT基因型个体的脂肪含量、胴体重均显著高于CC型个体,大理石花纹等级优于CC基因型,CC基因型个体的蛋白含量显著高于CT基因型。2.在FABP4基因中存在呈中度多态的6个SNP位点。关联性分析显示:3496 bp A→C位点与延边黄牛脂肪含量、蛋白含量呈显著相关性,AC型个体的脂肪含量显著高于AA型和CC型个体,AA基因型和CC基因型的蛋白含量均显著高于AC基因型个体,AC基因型大理石花纹显著好于CC基因型;3533 bp A→T位点与延边黄牛脂肪含量、蛋白含量呈显著相关性,在脂肪含量上,AT基因型显著高于AA型和TT型个体,在蛋白含量上,AA型和TT型均显著高于AT基因型个体,AT基因型大理石花纹显著好于TT基因型;3691 bp G→A位点与延边黄牛水分含量、脂肪含量、蛋白含量呈不同程度显著相关,表现为GG型个体水分含量显著高于GA型和AA型个体,GA型个体的脂肪含量显著高于GG型和AA型个体,GG型和AA型个体的蛋白含量显著高于GA基因型个体;3711 bp G→C位点与延边黄牛脂肪含量和蛋白含量呈显著相关,表现为GC型个体的脂肪含量显著高于GG型和CC型个体,GG型和CC型个体蛋白含量显著高于GC型个体,GC基因型大理石花纹显著好于CC基因型;3745 bp T→C位点与脂肪含量和蛋白含量呈显著相关,表现为TC型个体脂肪含量显著高于TT型和CC型个体,TT型和CC型个体蛋白含量显著高于TC型个体,TC基因型大理石花纹显著好于CC基因型;3767 bp T→C位点与脂肪含量和蛋白含量呈显著相关,表现为TC型的脂肪含量显著高于TT型和CC型,TT型和CC型的蛋白含量显著高于TC基因型个体,TC基因型大理石花纹显著好于CC基因型。3496 bp A→C、3533 bp A→T、3711 bp G→C、3745 bp T→C、3767 bp T→C位点处于连锁不平衡状态,具有相似的遗传效应。3.PLIN基因中存在呈低度多态的2个SNP位点。103 bp C→T位点与延边黄牛脂肪含量、宰前重、胴体重、背膘厚呈显著相关性,表现为CT基因型个体脂肪含量、宰前重、胴体重、背膘厚均显著高于CC型个体;156 bp T→C位点与延边黄牛的宰前重、胴体重以及背膘厚呈显著相关性,表现为TC型的宰前重、胴体重以及背膘厚度均显著高于TT型个体。4.FABP4、PPAR y、ANGPTL4、LPL 在延边黄牛 FABP4 基因 3496 bp A→C 位点、3533 bp A→T 位点、3711 bp G→C 位点、3745 bp T→C 位点、3767 bp T→C位点的不同基因型个体中表达存在差异,表达水平从高到低依次是AA基因型、AB基因型、BB基因型。在FABP4基因表达中,AA基因型表达水平极显著高于AB型和BB型;PPARγ基因表达中AA型表达量显著高于BB型;ANGPTL4基因表达中AA基因型表达量显著高于AB型和BB型;LPL基因表达中AA型表达量极显著高于BB型和AB型。
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